Artículo de revista
Chloroplast genome of Tillandsia marconae till & Vitek (Bromeliaceae), a hyperarid desert endangered species
Genoma del cloroplasto de Tillandsia marconae till & Vitek (Bromeliaceae), una especie en peligro de extinción del desierto hiperárido
Registro en:
2380-2359
10.1080/23802359.2021.1944364
TX5MT
34395883
WOS:000683135300001
Autor
Cesar Chavez-Galarza, Julio
Cardenas-Ninasivincha, Stefanny
Contreras, Roberto
Ferro-Mauricio, Ruben
Huanca-Mamani, Wilson
Institución
Resumen
Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) is a rare plant native species that grows over sand, in the coastal desert from Peru and Chile and is considered an endangered species. In this study, we assembled its chloroplast genome. The draft chloroplast genome of T. marconae is ca. 158,873 bp in length, containing a large single-copy region of 86,937 bp, a small single-copy region of 18,506 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,715 bp. The GC content of the draft chloroplast genome is 37.4%. It encodes a total of 135 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes, 8 rRNA genes, and three pseudogenes. The phylogenetic tree indicated that T. marconae is placed within the Bromeliaceae family and a close relationship with Tillandsia usneoides with 100% support. Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) es una especie nativa de planta rara que crece sobre la arena, en el desierto costero de Perú y Chile y se considera una especie en peligro de extinción. En este estudio, ensamblamos su genoma de cloroplasto. El borrador del genoma del cloroplasto de T. marconae es ca. 158.873 pb de longitud, que contiene una gran región de copia única de 86.937 pb, una pequeña región de copia única de 18.506 pb y un par de regiones repetidas invertidas de 26.715 pb. El contenido de GC del borrador del genoma del cloroplasto es del 37,4%. Codifica un total de 135 genes, incluidos 86 genes que codifican proteínas, 38 genes de ARNt, 8 genes de ARNr y tres pseudogenes. El árbol filogenético indicó que T. marconae se ubica dentro de la familia Bromeliaceae y una estrecha relación con Tillandsia usneoides con 100% de apoyo.