Ab initio calculations at the MP2/6-31G** level have been carried out on the non-Watson-Crick nucleic acids pairs G center dot U and U center dot U to obtain the interaction energies and to see whether the derived values are comparable or not with the canonical G-C, A-T and A-U pairs. Optimized geometries of the pairs show that the structural parameters of the isolated bases differ very little on pairing. The guanine -NH2 group does not participate in the hydrogen bonding formation and possesses a pyramidal structure; its intrinsic nonplanarity plays an important role in the out-of-plane intermolecular interactions. Thus, the G center dot U pair projects three hydrogen bonding acceptor sites, namely, N7(G), O6(G) and O4(U) to the RNA major groove. The interaction energy (Delta H degrees(int)) calculated for the G center dot U pair (-13.6 kcal/mol) is comparable to that determined for A-T (-13.0 kcal/ mol), but considerable smaller than the experimental value reported for G-C (-21.0 kcal/mol). The U center dot U pair follows the trend that pairing between pyrimidines bases should have lower interacting energies than purine-pyrimidine pairs.Se han realizado cálculos ab initio al nivel MP2/6-31G** en los pares de ácidos nucleicos que no son de Watson-Crick G punto central U y U punto central U para obtener las energías de interacción y ver si los valores derivados son comparables o no con los pares canónicos GC, AT y AU. Las geometrías optimizadas de los pares muestran que los parámetros estructurales de las bases aisladas difieren muy poco en el emparejamiento. El grupo guanina -NH2 no participa en la formación de puentes de hidrógeno y posee una estructura piramidal; su no planaridad intrínseca juega un papel importante en las interacciones intermoleculares fuera del plano. Por lo tanto, el par U del punto central G proyecta tres sitios aceptores de enlaces de hidrógeno, a saber, N7 (G), O6 (G) y O4 (U) al surco principal del ARN. La energía de interacción (Delta H grados(int)) calculada para el par U del punto central G (-13,6 kcal/mol) es comparable a la determinada para AT (-13,0 kcal/mol), pero considerablemente menor que el valor experimental informado para GC (-21,0 kcal/mol). El par U centro punto U sigue la tendencia de que el emparejamiento entre bases de pirimidinas debería tener energías de interacción más bajas que los pares de purina-pirimidina.