La bioinformática como herramienta para el conocimiento de microorganismos edáficos con potencial para la producción agrícola sostenible, recuperación y conservación de suelos

Abstract

Las herramientas bioinformáticas se han consolidado como la tecnología vanguardista con un uso cada vez más frecuente en áreas profesionales de especialidades clínicas, ambientales y agropecuarias, para esta última, las herramientas bioinformáticas son necesarias para una representación completa de microorganismos benéficos en suelos destinados para cultivo, entre otros usos. En la presente investigación se realizó una revisión tipo documental de investigaciones científicas que utilizaron herramientas bioinformáticas algunas de las cuales fueron (QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology), Mothur, UPARSE y Usearch), con el propósito de identificar y caracterizar microorganismos del suelo. La revisión documental, arrojó como resultado la existencia en la actualidad de una gran variedad de programas y técnicas que permiten la obtención de información de microorganismos en diferentes tipos de suelo y climas que luego se identificaron mediante bases de datos especializadas como GenBank, EMBL-EBI, DDBJ, entre otras; encontrándose principalmente microorganismos de diferentes especies pertenecientes a las Actinobacterias, Acidobacterias y Gammaproteobacterias, las cuales cumplen un papel importante en la salud de los suelos. Este trabajo ha sido pensado como documento de consulta base para futuras investigaciones en el campo de la agricultura, en donde se necesite conocer qué tipo de microorganismos benéficos para cultivos existen en los suelos de las áreas de estudio y qué herramientas bioinformáticas de las más usadas hoy en día, son las mejores para caracterizarlos e identificarlos.