Dissertação
Prospecção, análises e design in silico de potenciais inibidores da proteína NS3 do vírus zika
Prospection, analysis and in silico design of potential inhibitors of zika virus' NS3 protein
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Author
Resende, Millena Almeira
Institutions
Abstract
Zika virus belongs to the Flavivirus genus and is transmitted, mainly, by the Aēdēs ægypti
female mosquito. Infected individuals have variable symptoms and may have neurological
complications, some of which are irreversible, such as microcephaly, in cases of intrauterine
infection. In addition, there are still no effective drugs for the treatment of this viral disease.
However, there are still no effective drugs to treat this disease. That’s why, this work aimed to
identify potential compounds with antiviral action using as a therapeutic target the Zika virus
NS3 protease. Therefore, computational methods such as the construction of a shape-based
model, virtual screening, covalent and non-covalent molecular docking, molecular modification
and prediction of pharmacological characteristics were used. The protein and compounds tested
were obtained through a virtual database of compounds, such as: natural compounds, leadlike,
druglike and approved compounds (eg, drugs approved by the FDA). Through virtual screening
and molecular docking, it was possible to select the compounds from each group with greater
affinity to the NS3 protease: 8D, 1L, 6F and 1N. The compound identified as 6F refers to the
drug Betrixaban indicating a potential repositioning of it for use against Zika virus. Compound
1N refers to Cryptomoscatone D1, present in Lauraceae Cryptocarya moschata and Lauraceae
Cryptocarya mandioccana. The 8D and 1N compounds obtained the best docking and
pharmacokinetic results and would be the most suitable for in vitro analysis. Dissertação (Mestrado) O vírus Zika pertence ao gênero Flavivirus e é transmitido, principalmente, pela fêmea do
mosquito Aēdēs ægypti. Indivíduos infectados apresentam sintomas variáveis e podem ter
complicações neurológicas, sendo algumas irreversíveis, como a microcefalia, em casos de
infecção intrauterina. Além disso, ainda não existem medicamentos eficazes para o tratamento
desta virose. Por isso, este trabalho teve como objetivo, identificar potenciais compostos com
ação antiviral utilizando como alvo terapêutico a protease NS3 do vírus Zika. Para tanto, foram
empregados métodos computacionais como a construção de modelo baseado em forma, triagem
virtual, docking molecular covalente e não covalente, modificação molecular e predição de
características farmacológicas. A obtenção da proteína e dos compostos testados se deu através
de banco de dados virtuais de compostos, tais como: compostos naturais, leadlike, druglike e
compostos aprovados (Ex: fármacos aprovados pelo FDA). Por meio da triagem virtual e docking
molecular foi possível selecionar os compostos de cada grupo com maior afinidade à protease
NS3: 8D, 1L, 6F e 1N. O composto identificado como 6F refere-se ao fármaco Betrixaban
indicando um potencial reposicionamento deste para o uso contra o vírus Zika. O composto 1N
refere-se à Criptomoscatona D1, presente nas plantas Lauraceae Cryptocarya moschata e
Lauraceae Cryptocarya mandioccana. Os compostos 8D e 1N obtiveram os melhores resultados
de docking e farmacocinética e seriam os mais indicados para análises in vitro.