Dissertação
Estimativa dos pKa da Rutina empregando modelos semi-empíricos de cálculo mecânico-quântico
Registro en:
EUQUERES, Jander Silva. Estimativa dos pKa da Rutina empregando modelos semi-empíricos de
cálculo mecânico-quântico. 2009. 82 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2009.
Autor
Euqueres, Jander Silva
Institución
Resumen
In this study, molecular and thermodynamic properties of rutin molecule
in the gas phase and in water, with the inclusion of discrete water molecules in
specific locations, were studied by means of quantum mechanical calculations,
using a tool specifically the semi-empirical methods AM1 and PM6 for the
theoretical calculation of pKa. The inclusion of discrete molecules of water
aimed a better description of solute-solvent interaction with minimal
computational requirements.
The results suggest that the theoretical values compared with the
experimental results obtained a relative success using the Cosmo solvation
model, with insertion of discrete water molecules. This methodology provided a
relatively low computational investment with more simplified mathematical
relationships, and did not use correction equations for the calculation of pKa.
This work presented in some cases results similar to those presented in the
literature with ab-initio calculations, with errors of 0.53 units of PKA (Pliego,
2003). The semi-empirical method PM6 was the more satisfactory, reaching an
error of 0.63 pKa units for the calculation of pKa1 and 0.76 pKa units for pKa2. Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais Mestre em Química Neste trabalho, propriedades moleculares e termodinâmicas da molécula
da rutina na fase gasosa e em meio aquoso, com a inserção de moléculas
discretas de água em posições específicas, foram estudadas por meios de
cálculos mecânico quânticos, utilizando especificamente como ferramenta os
métodos semi-empíricos AM1 e o PM6 para o cálculo teórico do pKa. A
inserção de moléculas discretas de água visou uma melhor descrição da
interação soluto-solvente com o mínimo de demanda computacional.
Os resultados permitem concluir que os valores teóricos comparados
com os resultados experimentais obtiveram um relativo sucesso com a
utilização do modelo de solvatação Cosmo, com a inserção de moléculas
discretas de água. Essa metodologia apresenta um investimento computacional
relativamente baixo com relações matemáticas mais simplificadas, além de não
utilizar equações de correção para o cálculo do pKa. Este trabalho apresentou
em alguns casos resultados equiparados aos apresentados na literatura com
cálculos ab-initio, com erros de 0,53 unidades de pka (Pliego, 2003). O método
semi-empírico PM6 foi que apresentou um desempenho com índice mais
satisfatório, chegando apresentar um erro de 0,63 unidades de pka para o
cálculo do pKa1, e 0,76 unidades de pka para o cálculo do pKa2.