Tese
Correção de artefatos e teste de hipóteses baseados em modelos da resposta mismatch negativity em sinais de EEG para aplicações em tempo real
Artifact correction and hypothesis testing based on models of mismatch negativy response in EEG signals for real-time applications
Registro en:
Autor
Freitas, Amanda Medeiros de
Institución
Resumen
Brain-Machine Interfaces use brain signals for real-time control of various assisitve
systems, such as alternative communication devices, upper-limb prostheses, exoskeletons,
wheelchairs, etc. These approaches face intrinsic challenges, such as the removal of artifacts to extract reliable features in single-trial, especially when the cortical activity is
measured by electroencephalography (EEG). In addition to the artifacts, another problem
is the cortical response, since it presents variability between subjects and over time. Some
studies have also shown that there is a statistically significant difference in cortical response between healthy subjects and Amyotrophic Lateral Sclerosis patients. In this way,
computational models compare different models and identify which one best explains the
cortical signal by EEG. However, developing experiments able to conclusively discriminate
models is not trivial. However, developing experiments able to conclusively discriminate
models is not trivial. Therefore, the hypothesis of this research is that the combined
use of real-time artifact correction and an optimized adaptive system can provide more
accurate and faster responses to cortical sensory perception through EEG data in online
and single-trial analyses.
There are some approaches to online artifact correction. Still, none is being used as a
“gold-standard”, and no research has been conducted to analyze and compare their respective effects by employing inference-based decision, that is, the comparison of mathematical
models that aim to explain the cortical dynamics due to some external event. Therefore,
in the first part of this research, we evaluated methods for artifact correction and the necessary adjustments to implement them in single-trial for online electroencephalographic
(EEG) analysis. We investigate the following methods: Artifact Subspace Reconstruction (ASR), Fully Online and automated artifact Removal for brain-Computer interfacing
(FORCe), Empirical Model Decomposition online (EMD), and Independent Component
Analysis online (ICA). For assessment, we simulate online data processing using real data
from an oddball auditory task. We compare the above methods with a classical offline
data processing, in their ability (i) to reveal a significant Mismatch Negativity (MMN)
response to auditory stimuli; (ii) to reveal the more subtle modulation of the MMN by contextual changes (namely, the predictability of the sound sequence) and (iii) to identify the cortical process modeling of sensory perception most likely to explain the MMN
response. Our results show that ASR and EMD are both able to reveal MMN and its
modulation by predictability, and even appear more sensitive than the offline analysis
when comparing alternative models of perception underlying auditory evoked responses.
In the second part of this research, we specifically explore cortical modeling. Some
studies propose the implementation of adaptive designs, which make it possible to distinguish between models faster and more accurately. However, to date, no study has
explored hypothesis testing (model comparison) considering sensory perception computational modeling (MMN) to optimize real-time experimental designs based on single-trial
EEG signals. Our results with simulated data showed that the hypothesis testing was
able to conclude in favor of the model that generated the data. Besides, adaptive design
showed better results than the classic design. The results with real data showed variability in the cortical response between subjects and also in terms of the experimental block
(predictability in the sound sequence). The adaptive design showed more results in favor
of alternative models, while the classic design, in favor of the null model.
The combination of real-time artifact correction and adaptive design proved to be
feasible to identify the computational model that best explains the cortical response in
single-trial analysis of the EEG signal. These results are important for ICM applications
as they can identify whether the subject is able to use the system and also to investigate
changes in his cortical response over time. CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Tese (Doutorado) As Interfaces Cérebro-Máquina utilizam sinais cerebrais para controlar em tempo real
diversos mecanismos assistivos, como por exemplo, dispositivos de comunicação alternativa, próteses de membros superiores, exoesqueletos, cadeiras de rodas, entre outros.
Estas abordagens enfrentam desafios intrínsecos ao sistema, como a remoção de artefatos
para extração confiável de características corticais em single-trial, especialmente quando
a atividade cortical é mensurada por eletroencefalografia (EEG). Além dos artefatos, outro problema na implementação de sistemas ICMs é a resposta cortical do usuário, uma
vez que cada sujeito possui sua própria dinâmica cortical, que varia ao longo do tempo.
Alguns estudos também mostraram que existem diferença estatística significativa na resposta cortical entre sujeitos saudáveis e pacientes com Esclerose Lateral Amiotrófica.
Desta maneira, modelos computacionais visam comparar diferentes modelos e identificar
qual deles melhor explica o sinal cortical por meio do EEG. Entretanto, desenvolver experimentos capazes de discriminar conclusivamente os modelos em análises não é trivial.
Alguns estudos, utilizando dados simulados, mostraram a viabilidade de utilizar design
adaptativos e otimizados para melhorar a comparação dos modelos computacionais. Portanto, a hipótese deste trabalho é que a utilização conjunta de correção de artefatos em
tempo real e um sistema adaptativo e otimizado podem proporcionar respostas mais acuradas e rápidas sobre a resposta cortical por meio de dados reais de EEG em análises
online e em single-trial.
Existem alguns métodos para correção de artefatos online, mas nenhum deles está
sendo utilizado como um “padrão ouro” e nenhuma pesquisa foi conduzida para analisar
e comparar seus respectivos efeitos por meio de decisão baseada em inferência, ou seja,
comparação de modelos matemáticos que visam explicar a dinâmica cortical em decorrência de algum evento. Portanto, na primeira parte do trabalho, avaliamos métodos para
correção de artefatos e os ajustes necessários para implementá-los em single-trial para a
análise online de EEG. Investigamos os seguintes métodos: Artifact Subspace Reconstruction (ASR), Fully Online and automated artifact Removal for brain-Computer interfacing (FORCe), Empirical Mode Decomposition (EMD) online, e Independent Component Analysis (ICA) online. Para avaliação, simulamos o processamento de dados online utilizando dados reais obtidos por meio de um paradigma oddball auditivo. Comparamos os
métodos acima com um processamento de dados offline clássico, em sua capacidade (i) de
revelar uma resposta significativa de Mismatch Negativity (MMN) aos estímulos auditivos;
(ii) revelar a modulação mais sutil do MMN por mudanças contextuais (previsibilidade na
sequência sonora) e (iii) identificar a modelagem do processo cortical de percepção sensorial mais provável de explicar a resposta MMN. Nossos resultados alcançados mostram
que os métodos ASR e EMD são capazes de revelar a resposta MMN e sua modulação
por previsibilidade, e até se mostram mais sensíveis que a análise offline na comparação
dos modelos alternativos de percepção sensorial às respostas evocadas auditivas.
Na segunda parte do trabalho, exploramos especificamente a modelagem cortical. Alguns estudos propõem a implementação de designs adaptativos, que possibilitam a distinção entre os modelos de forma mais rápida e acurada. Entretanto, até o presente
momento, nenhum estudo explorou o teste de hipóteses (comparação dos modelos) considerando a modelagem computacional de percepção sensorial (MMN) para adaptar e
otimizar o design experimental para aplicações em tempo real baseado em sinais reais de
EEG em single-trial. Nossos resultados com dados simulados mostraram que o teste de
hipóteses foi capaz de concluir em favor do modelo que gerou os dados. Além disso, o
design adaptativo apresentou melhores resultados do que o design clássico. Os resultados
com dados reais mostrou variabilidade na resposta cortical entre os sujeitos e também
quanto ao bloco experimental (previsibilidade na sequência sonora). O design adaptativo
mostrou mais resultados em favor dos modelos alternativos, enquanto o design clássico,
em favor do modelo nulo.
A combinação da correção de artefatos em tempo real e do design adaptativo mostrou
ser viável para identificar o modelo computacional que melhor explica a resposta cortical
em análise single-trial do sinal EEG. Estes resultados são importantes para aplicações
de ICMs pois podem identificar se o sujeito é apto a utilizar o sistema e também para
investigar as alterações de sua resposta cortical ao longo do tempo.