Diseases associated with chronic hypoxaemia are a leading cause of morbidity and mortality in Western countries. Epidemiological data indicate that cardiovascular diseases contribute substantially to this problem, but the underlying mechanisms are incompletely understood. Sleep disordered breathing and high altitude exposure are frequent conditions associated with hypoxaemia. Recent evidence suggests that in these conditions the concomitant presence of a patent foramen ovale plays an important pathogenic role. For example, in patients with obstructive sleep apnoea the presence of a patent foramen ovale is associated with more severe sleep disordered breathing, nocturnal oxygen desaturation, generalised endothelial dysfunction and arterial hypertension. After patent foramen ovale closure, both sleep disordered breathing and cardiovascular phenotype improve, suggesting the existence of a possible causal link. During short-term high altitude exposure, the presence of a patent foramen ovale, by aggravating altitude-induced hypoxaemia, facilitates exaggerated pulmonary hypertension. Interestingly, there is increasing evidence showing that in high-altitude dwellers a patent foramen ovale also alters the cardiovascular phenotype. In this article we will summarise recent evidence demonstrating how a patent foramen ovale alters the cardiovascular phenotype and increases cardiovascular risk in patients with sleep disordered breathing and high-altitude dwellers.Las enfermedades asociadas a la hipoxemia crónica son una de las principales causas de morbilidad y mortalidad en los países occidentales. Los datos epidemiológicos indican que las enfermedades cardiovasculares contribuyen sustancialmente a este problema, pero los mecanismos subyacentes no se conocen por completo. Los trastornos respiratorios durante el sueño y la exposición a grandes alturas son condiciones frecuentes asociadas con la hipoxemia. La evidencia reciente sugiere que en estas condiciones la presencia concomitante de un foramen oval permeable juega un papel patogénico importante. Por ejemplo, en pacientes con apnea obstructiva del sueño, la presencia de un foramen oval permeable se asocia con trastornos respiratorios del sueño más graves, desaturación nocturna de oxígeno, disfunción endotelial generalizada e hipertensión arterial. Después del cierre del foramen oval permeable, tanto los trastornos respiratorios del sueño como el fenotipo cardiovascular mejoran, lo que sugiere la existencia de un posible vínculo causal. Durante la exposición breve a gran altitud, la presencia de un foramen oval permeable, al agravar la hipoxemia inducida por la altitud, facilita la hipertensión pulmonar exagerada. Curiosamente, cada vez hay más pruebas que muestran que en los habitantes de grandes alturas un foramen oval permeable también altera el fenotipo cardiovascular. En este artículo resumiremos la evidencia reciente que demuestra cómo un foramen oval permeable altera el fenotipo cardiovascular y aumenta el riesgo cardiovascular en pacientes con trastornos respiratorios del sueño y habitantes de grandes alturas.