Studies focusing on biological differences among groups have been a widespread area of anthropological research for decades. One of the most common means of assessing biological differences is through comparing craniofacial metrics. Craniofacial growth is under genetic control but strongly influenced by environmental factors, including artificial cranial modification (ACM). Some scholars believe ACM affects craniofacial metrics, but other scholars disagree. This study seeks to remedy this debate. A total of 218 adult crania (101 unmodified, 117 modified) from coastal and inland sites of three northern Chilean valleys were surveyed and examined for craniofacial metric changes through the use of modern orthodontic cephalometric analyses. Unmodified crania were statistically tested with the hierarchical linear analysis test to determine if there were any differences based on site, region (coast vs. inland), period, or sex within the unmodified sample, followed by a comparison of these data to modified cranial data. Statistical tests, specifically the ANOVA test, of the data determined that ACM affected some but not all craniofacial measurements utilized in this study. This conclusion, coupled with the varying conclusions of similar previously conducted studies, suggests that scholars must be cautious in employing modified crania and craniofacial metrics in any study of biological affinities.Los estudios que se centran en las diferencias biológicas entre los grupos han sido un área muy extendida de investigación antropológica durante décadas. Uno de los medios más comunes para evaluar las diferencias biológicas es comparar las métricas craneofaciales. El crecimiento craneofacial está bajo control genético pero fuertemente influenciado por factores ambientales, incluida la modificación craneal artificial (ACM). Algunos académicos creen que ACM afecta las métricas craneofaciales, pero otros académicos no están de acuerdo. Este estudio busca remediar este debate. Un total de 218 cráneos adultos (101 sin modificar, 117 modificados) de sitios costeros y del interior de tres valles del norte de Chile fueron estudiados y examinados en busca de cambios métricos craneofaciales mediante el uso de modernos análisis cefalométricos de ortodoncia. Los cráneos no modificados se probaron estadísticamente con la prueba de análisis lineal jerárquico para determinar si había alguna diferencia según el sitio, la región (costa vs. tierra adentro), el período o el sexo dentro de la muestra no modificada, seguido de una comparación de estos datos con los datos craneales modificados. . Las pruebas estadísticas, específicamente la prueba ANOVA, de los datos determinaron que ACM afectó algunas pero no todas las mediciones craneofaciales utilizadas en este estudio. Esta conclusión, junto con las diversas conclusiones de estudios similares realizados anteriormente, sugiere que los académicos deben ser cautelosos al emplear métricas craneofaciales y craneales modificadas en cualquier estudio de afinidades biológicas.