Artículo de revista
Novel genetic loci affecting facial shape variation in humans
Nuevos loci genéticos que afectan la variación de la forma facial en humanos
Registro en:
2050-084X
10.7554/eLife.49898
JV3XW
3176398+
WOS:000502300200001
Autor
Xiong, Ziyi
Dankova, Gabriela
Howe, Laurence J.
Lee, Myoung Keun
Hysi, Pirro G.
de Jong, Markus A.
Zhu, Gu
Adhikari, Kaustubh
Li, Dan
Li, Yi
Pan, Bo
Feingold, Eleanor
Marazita, Mary L.
Shaffer, John R.
McAloney, Kerrie
Xu, Shu-Hua
Jin, Li
Wang, Sijia
de Vrij, Femke M. S.
Lendemeijer, Bas
Richmond, Stephen
Zhurov, Alexei
Lewis, Sarah
Sharp, Gemma C.
Paternoster, Lavinia
Thompson, Holly
Gonzalez-Jose, Rolando
Bortolini, Maria Catira
Canizales-Quinteros, Samuel
Gallo, Carla
Poletti, Giovanni
Bedoya, Gabriel
Rothhammer, Francisco
Uitterlinden, Andre Prime G.
Ikram, M. Arfan
Wolvius, Eppo
Kushner, Steven A.
Nijsten, Tamar E. C.
Palstra, Robert-Jan T. S.
Boehringer, Stefan
Medland, Sarah E.
Tang, Kun
Ruiz-Linares, Andres
Martin, Nicholas G.
Spector, Timothy D.
Stergiakouli, Evie
Weinberg, Seth M.
Liu, Fan
Kayser, Manfred
Institución
Resumen
The human face represents a combined set of highly heritable phenotypes, but knowledge on its genetic architecture remains limited, despite the relevance for various fields. A series of genome-wide association studies on 78 facial shape phenotypes quantified from 3-dimensional facial images of 10,115 Europeans identified 24 genetic loci reaching study-wide suggestive association (p < 5 x 10(-8)), among which 17 were previously unreported. A follow-up multi-ethnic study in additional 7917 individuals confirmed 10 loci including six unreported ones (P-adjusted < 2.1 x 10(-3)). A global map of derived polygenic face scores assembled facial features in major continental groups consistent with anthropological knowledge. Analyses of epigenomic datasets from cranial neural crest cells revealed abundant cis-regulatory activities at the faceassociated genetic loci. Luciferase reporter assays in neural crest progenitor cells highlighted enhancer activities of several face-associated DNA variants. These results substantially advance our understanding of the genetic basis underlying human facial variation and provide candidates for future in-vivo functional studies. El rostro humano representa un conjunto combinado de fenotipos altamente hereditarios, pero el conocimiento sobre su arquitectura genética sigue siendo limitado, a pesar de su relevancia para varios campos. Una serie de estudios de asociación de todo el genoma en 78 fenotipos de formas faciales cuantificados a partir de imágenes faciales tridimensionales de 10.115 europeos identificaron 24 loci genéticos que alcanzaron una asociación sugestiva en todo el estudio (p < 5 x 10(-8)), entre los cuales 17 fueron previamente No denunciado. Un estudio multiétnico de seguimiento en 7917 personas adicionales confirmó 10 loci, incluidos seis no informados (P ajustado < 2,1 x 10(-3)). Un mapa global de puntuaciones faciales poligénicas derivadas reunió rasgos faciales en los principales grupos continentales de acuerdo con el conocimiento antropológico. Los análisis de conjuntos de datos epigenómicos de células de la cresta neural craneal revelaron abundantes actividades reguladoras en cis en los loci genéticos asociados a la cara. Los ensayos de indicador de luciferasa en células progenitoras de la cresta neural destacaron las actividades potenciadoras de varias variantes de ADN asociadas a la cara. Estos resultados mejoran sustancialmente nuestra comprensión de la base genética que subyace a la variación facial humana y proporcionan candidatos para futuros estudios funcionales in vivo.