Artículo de revista
Native American ancestry significantly contributes to neuromyelitis optica susceptibility in the admixed Mexican population
La ascendencia nativa americana contribuye significativamente a la susceptibilidad a la neuromielitis óptica en la población mexicana mezclada
Registro en:
2045-2322
10.1038/s41598-020-69224-3
NF8MM
32792643
WOS:000563546900002
Autor
Romero-Hidalgo, Sandra
Flores-Rivera, Jose
Rivas-Alonso, Veronica
Barquera, Rodrigo
Teresa Villarreal-Molina, Maria
Antuna-Puente, Barbara
Rodrigo Macias-Kauffer, Luis
Villalobos-Comparan, Marisela
Ortiz-Maldonado, Jair
Yu, Neng
Lebedeva, Tatiana, V
Alosco, Sharon M.
Daniel Garcia-Rodriguez, Juan
Gonzalez-Torres, Carolina
Rosas-Madrigal, Sandra
Ordonez, Graciela
Luis Guerrero-Camacho, Jorge
Trevino-Frenk, Irene
Escamilla-Tilch, Monica
Garcia-Lechuga, Maricela
Hugo Tovar-Mendez, Victor
Pacheco-Ubaldo, Hanna
Acuna-Alonzo, Victor
Bortolini, Maria-Catira
Gallo, Carla
Bedoya, Gabriel
Rothhammer, Francisco
Gonzalez-Jose, Rolando
Ruiz-Linares, Andres
Canizales-Quinteros, Samuel
Yunis, Edmond
Granados, Julio
Corona, Teresa
Institución
Resumen
Neuromyelitis Optica (NMO) is an autoimmune disease with a higher prevalence in non-European populations. Because the Mexican population resulted from the admixture between mainly Native American and European populations, we used genome-wide microarray, HLA high-resolution typing and AQP4 gene sequencing data to analyze genetic ancestry and to seek genetic variants conferring NMO susceptibility in admixed Mexican patients. A total of 164 Mexican NMO patients and 1,208 controls were included. On average, NMO patients had a higher proportion of Native American ancestry than controls (68.1% vs 58.6%; p=5x10(-6)). GWAS identified a HLA region associated with NMO, led by rs9272219 (OR=2.48, P=8x10(-10)). Class II HLA alleles HLA-DQB1*03:01, -DRB1*08:02, -DRB1*16:02, -DRB1*14:06 and -DQB1*04:02 showed the most significant associations with NMO risk. Local ancestry estimates suggest that all the NMO-associated alleles within the HLA region are of Native American origin. No novel or missense variants in the AQP4 gene were found in Mexican patients with NMO or multiple sclerosis. To our knowledge, this is the first study supporting the notion that Native American ancestry significantly contributes to NMO susceptibility in an admixed population, and is consistent with differences in NMO epidemiology in Mexico and Latin America. La neuromielitis óptica (NMO) es una enfermedad autoinmune con una mayor prevalencia en poblaciones no europeas. Debido a que la población mexicana resultó de la mezcla entre poblaciones principalmente nativas americanas y europeas, utilizamos microarrays de todo el genoma, tipificación de alta resolución de HLA y datos de secuenciación del gen AQP4 para analizar la ascendencia genética y buscar variantes genéticas que confieran susceptibilidad a NMO en pacientes mexicanos mezclados. Se incluyeron un total de 164 pacientes mexicanos con NMO y 1208 controles. En promedio, los pacientes con NMO tenían una mayor proporción de ascendencia nativa americana que los controles (68,1% frente a 58,6 %; p = 5x10(-6)). GWAS identificó una región HLA asociada con NMO, liderada por rs9272219 (OR = 2.48, P = 8x10 (-10)). Los alelos HLA de clase II HLA-DQB1*03:01, -DRB1*08:02, -DRB1*16:02, -DRB1*14:06 y -DQB1*04:02 mostraron las asociaciones más significativas con el riesgo de NMO. Las estimaciones de ascendencia local sugieren que todos los alelos asociados con NMO dentro de la región HLA son de origen nativo americano. No se encontraron variantes nuevas o sin sentido en el gen AQP4 en pacientes mexicanos con NMO o esclerosis múltiple. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que respalda la noción de que la ascendencia de nativos americanos contribuye significativamente a la susceptibilidad a NMO en una población mixta, y es consistente con las diferencias en la epidemiología de NMO en México y América Latina.