Understanding the interspecific morphological variability of Caquetaia kraussii (Perciformes: Cichlidae) between different localities in its distribution range is becoming essential, as this species constitutes a valuable resource for the economy and subsistence of the local human communities where it is endemic in Colombia and Venezuela. In order to develop efficient farming and handling plans for this species, a deep understanding of the factors and mechanisms generating morphological variability is crucial. This study analyzes the morphological variability of C. kraussii by using geometric morphometrics in four localities distributed between the Dique and North channels, which are part of the Bolivar department in Colombia. Likewise, the effect of environmental variables such as temperature (Tffi), dissolved oxygen (OD) and pH on morphological variability was analyzed using a partial least squares approach. The results show that environmental stress has an influence on similar to 10% of the body shape of C. kraussii, whereas similar to 90% of the body shape is not directly influenced by environmental parameters, suggesting an effect from stress related to sexual dimorphism. Similarly, the analyses show shape variation among localities, mainly between populations of lotic environments and those of lentic environments. This morphological disparity seems to be subject to environmental and sexual stresses in the different localities.Comprender la variabilidad morfológica interespecífica de Caquetaia kraussii (Perciformes: Cichlidae) entre diferentes localidades en su rango de distribución se está volviendo fundamental, ya que esta especie constituye un recurso valioso para la economía y subsistencia de las comunidades humanas locales donde es endémica en Colombia y Venezuela. Para desarrollar planes de cultivo y manejo eficientes para esta especie, es crucial una comprensión profunda de los factores y mecanismos que generan la variabilidad morfológica. Este estudio analiza la variabilidad morfológica de C. kraussii mediante el uso de morfometría geométrica en cuatro localidades distribuidas entre los canales Dique y Norte, que forman parte del departamento de Bolívar en Colombia. Asimismo, se analizó el efecto de variables ambientales como temperatura (Tffi), oxígeno disuelto (OD) y pH sobre la variabilidad morfológica utilizando un enfoque de mínimos cuadrados parciales. Los resultados muestran que el estrés ambiental tiene una influencia similar al 10% de la forma del cuerpo de C. kraussii, mientras que similar al 90% de la forma del cuerpo no está directamente influenciada por los parámetros ambientales, lo que sugiere un efecto del estrés relacionado con el dimorfismo sexual. De igual forma, los análisis muestran variación de forma entre localidades, principalmente entre poblaciones de ambientes lóticos y aquellas de ambientes lénticos. Esta disparidad morfológica parece estar sujeta a tensiones ambientales y sexuales en las diferentes localidades.