O presente estudo objetivou discutir e analisar as questões referentes ao processo de implantação, atuação e consolidação do Programa Institucional Fiocruz Saudável, da Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), com foco no componente Saúde do Trabalhador. Pretende avançar na compreensão e identificação dos possíveis indicadores de impacto das ações de Saúde do Trabalhador em instituição de saúde. A metodologia esteve baseada na abordagem qualitativa descritiva com delineamento para estudo de caso, articulando uma análise documental com entrevistas semi-estruturadas, realizadas com informantes-chave e analisadas a partir de técnicas de análise de conteúdo. As análises dos dados de campo desvelaram questões importantes para a compreensão da estruturação de uma ação de saúde do trabalhador em uma Instituição como a Fiocruz. A complexidade dos processos de trabalho e a organização estrutural da Fiocruz aparecem como dois dos principais determinantes do não-alcance das ações de Saúde do Trabalhador na Instituição. Somam-se a esses determinantes a dificuldade da compreensão das diretrizes de Promoção da Saúde, Informação e Comunicação, principalmente por conta do desafio de articulação de saberes pautados pela Inter/transdisciplinaridade, que na prática não acontece tal qual idealizado pelos fundadores desse Programa. Apesar desses desafios, foram expostos instrumentos e ações de aprimoramento para o Programa a partir da ótica dos informantes-chave. Pensamos ser esse um ponto merecedor de atenção: a criação e desenvolvimento de estratégias de gestão-intervenção-formação em saúde que privilegiem os saberes oriundos do cotidiano, articulando a experiência de gestores, profissionais envolvidos com as ações de Saúde do Trabalhador e trabalhadores em geral.This study aimed to discuss and analyze some points regarding the implementation, actuation and consolidation of Healthy Fiocruz Institutional Program (Fiocruz Saudável), of the Oswaldo Cruz Foundation, highlighting the Worker’s Health component. Through this analysis, the study intends to advance in the comprehension and identification of some possible indicators of Worker’s Health actions impact. The methodological approach was based on qualitative health research techniques, outlining a descriptive case-study which articulated document analyzes and open-ended interviews with key-informants. Results revealed important issues for the comprehension of how difficult is to design a Worker’s Health Program in such a complex institution as Fiocruz. Work processes complexity and organizational structure were two of the main determinants for non-achieving Worker’s Health actions at the Institution. To these determinants was added the difficulty of comprehending the directives for Health Promotion, Information and Communication, particularly due the challenge of articulating different fields of knowledge based on the idealized view of inter/trans-disciplinary framework. Despite of these challenges, instruments and actions were exposed, through the key-informant speeches. We conclude believing that elaborating and developing strategies for management-intervention-formation in Worker’s Health is a goal to be pursued, especially through the articulation of different experiences and background from managers, Worker’s Health professional and workers in general