Thesis
Análise computacional de genomas de Plasmodium vivax e de potenciais genes relacionados à dormência
Registration in:
RIBEIRO, Ricardo de Souza. Análise computacional de genomas de Plasmodium vivax e de potenciais genes relacionados à dormência. Belo Horizonte. 2018. 118 f. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde)-Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde, Belo Horizonte, 2018.
Author
Ribeiro, Ricardo de Souza
Abstract
Plasmodium vivax é a espécie causadora da malária em humanos mais amplamente distribuída. O controle da doença causada por este parasito tem sido dificultado pela capacidade deste parasito desenvolver estágios dormentes no fígado, denominadas hipnozoítos, que podem dar origem a recaídas em diferentes intervalos de tempo. Além disso, os mecanismos de dormência no P. vivax ainda não foram elucidados. Neste trabalho, diferentes genomas de P. vivax foram analisados para determinação
da variabilidade genética. Análises in silico foram realizadas nos prováveis genes de dormência previamente identificados na literatura. Assim, foram selecionados aqueles com menor variabilidade genética e pressão seletiva negativa para manter a função de dormência. Dados de expressão relativos a estes genes também foram analisados para dar suporte a esta escolha. As possíveis interações entre as proteínas codificadas por estes genes foram verificadas utilizando o banco de dados String. Após esta análise, um conjunto de proteínas (n=15) que potencialmente interagem, foram utilizadas para propor uma hipótese de mecanismo de dormência.
Este mecanismo é baseado no transporte vesicular diferencial que acontece devido ao ferro disponível nos hepatócitos. Plasmodium vivax is the most widely distributed human malaria species. The control of the disease caused by this parasite has been hampered by the capacity of this parasite to develop dormant stages in the liver, called hypnozoites, that can give rise to relapses in different time intervals. In addition, the mechanisms of dormancy in P. vivax have not yet been elucidated. In this work, different P. vivax genomes were analyzed for genetic variability. In silico analyzes were performed on the likely
dormant genes previously identified in the literature. Thus, those with less genetic variability and negative selective pressure were selected to maintain dormancy function. Expression data relative to these genes were also analyzed to support this choice. The possible interactions between the proteins encoded by these genes were verified using the String database. After this analysis, a set of potentially interacting proteins (n = 15) were used to propose a hypothesis of dormancy mechanism. This mechanism is based on the differential vesicular transport that happens due to iron available in hepatocytes. 2040-01-01