Elementos virais endogenizados (EVEs) são sequências de origem viral que se integraram no genoma do seu hospedeiro. Nos últimos anos, uma quantidade crescente de estudos tem demonstrado que EVEs podem adquirir uma variedade de novas funções, modificando ou originando novos genes e redes regulatórias. Mosquitos são artrópodes vetores de vários arbovírus (vírus transmitidos por Artrópodes) responsáveis por causar infecções nas populações humanas: como o vírus da dengue, chikungunya e Zika. Arbovírus possuem uma forte associação com algumas espécies de mosquitos, o que sugere que estes tenham co-evoluído com culicídeos há alguns milhares de anos. A disponibilidade de dados genômicos de culicídeos nos permite compreender as relações evolutivas e o impacto dos EVEs no genoma desses insetos. Dessa maneira, este projeto teve como objetivo caracterizar a diversidade de EVEs presentes nos genomas de 36 espécies de culicídeos, os quais representam, em sua maioria, espécies de importância médica/epidemiológica, bem como identificar possíveis impactos nestes genomas. Foram identificadas 1998 sequências de origem viral no material genético de 36 espécies de culicídeos, representando um total de 27 famílias virais. As famílias Rhabdoviridae, Chuviridae e Flaviviridae apresentam a maior quantidade de elementos endogenizados, com 597, 459 e 228 elementos, respectivamente. Foi possível relacionar dois possíveis eventos evolutivos atrelados a EVEs da família Chuviridae, a possível origem de um novo retrovírus, fruto da hibridização de retroelementos Pao com o gene que é traduzido em glicoproteína de Chuvirus, e um possível mecanismo antiviral a partir de glicoproteínas endogenizadas. Estes resultados refletem uma grande diversidade de vírus integrados ao genoma de culicídeos, e levantam questões sobre a importância desses elementos nos genomas estudados.Endogenous Viral Elements (EVEs) are viral-derived sequences that became integrated into the host genome. In the last few years, several studies have demonstrated that EVEs can give origin to new functions at the molecular level, modifying or creating new genes and regulatory networks. Mosquitoes are arthropods vectors of several Arboviruses (Arthropod-borne viruses), the causative agents of human diseases like: Dengue, Chikungunya and Zika fever. Arboviruses have a strong association with mosquito species suggesting that the co-evolutionary process between mosquitoes and arboviruses is occurring since thousand years ago. The genomic data from culicids currently available allow us to investigate the evolutionary impact of EVEs using a comparative genomics approach. In this way, the main goal of this project is characterize the endogenous viral elements diversity on genomes from 36 species of mosquitoes, which represents, in most cases, species with medical and epidemiological importance, as well to identify the potential impacts on the host genome, by using public data and data generated in collaborative projects of the Instituto Aggeu Magalhães. Our results revealed 1998 EVEs sequences found on the genetic material of 36 mosquito species, representing a total of 27 viral families. The major part of endogenous elements belongs to the families Rhabdoviridae, Chuviridae and Flaviviridae with 597, 459, 228 EVEs respectively. Moreover, we also identified two evolutionary events related to EVEs from Chuviridae family: the putative origin of a new retrovirus due the hybridization of Pao retroelements and the Env gene of Chuviruses, and a putative antiviral mechanism from endogenized glycoproteins. Those results bring to light a wide diversity of viruses integrated into the mosquito genomes that infected or currently infect culicids and put on perspective which is the importance of these elements in the genomes studied .