Artigo
Differential Effect of Solution Conditions on the Conformation of the Actinoporins Sticholysin II and Equinatoxin II
Registro en:
Anais da Academia Brasileira de Ciências. Academia Brasileira de Ciências, v. 86, n. 4, p. 1949-1962, 2014.
0001-3765
10.1590/0001-3765201420140270
S0001-37652014000401949
S0001-37652014000401949.pdf
0000-0002-4767-0904
Autor
Fauth, Edson V.f.
Cilli, Eduardo M.
Ligabue-braun, Rodrigo
Verli, Hugo
Resumen
Actinoporins are a family of pore-forming proteins with hemolytic activity. The structural basis for such activity appears to depend on their correct folding. Such folding encompasses a phosphocholine binding site, a tryptophan-rich region and the activity-related N-terminus segment. Additionally, different solution conditions are known to be able to influence the pore formation by actinoporins, as for Sticholysin II (StnII) and Equinatoxin II (EqtxII). In this context, the current work intends to characterize the influence of distinct solution conditions in the conformational behavior of these proteins through molecular dynamics (MD) simulations. The obtained data offer structural insights into actinoporins dynamics in solution, characterizing its conformational behavior at the atomic level, in accordance with previous experimental data on StnII and EqtxII hemolytic activities. Actinoporinas constituem uma família de proteínas formadoras de poros com atividade hemolítica. A base estrutural para tal atividade parece depender do seu enovelamento correto, especialmente em torno de algumas regiões funcionais, incluindo um sítio de ligação a fosfocolina, uma região rica em resíduos de triptofano e o amino-terminal. Adicionalmente, diferentes condições de solvatação são reconhecidamente capazes de influenciar a formação de poros por actinoporinas, como observado para Sticolisina II (StnII) e Equinatoxina (EqtxII). Neste contexto, o presente trabalho visa caracterizar a influência de diferentes soluções no comportamento conformacional dessas proteínas, por meio de simulações de dinâmica molecular. Os dados obtidos fornecem insights estruturais sobre a dinâmica das actinoporinas em solução, caracterizando seu comportamento conformacional em nível atômico, de acordo com dados experimentais previamente obtidos para as atividades hemolíticas de StnII e EqtxII. Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) UFRGS Centro de Biotecnologia Universidade Estadual Paulista UNESP, Instituto de Química Departamento de Bioquímica e Tecnologia Química Universidade Estadual Paulista UNESP, Instituto de Química Departamento de Bioquímica e Tecnologia Química