Tesis Doctorado
Análisis de las regiónes genómicas 5' ncr, 3' ncr, eras, e2 y ns3 y su probable influencia en la eficiencia replicativa de un aislado naciónal (ch511) de virus diarréa viral bovina
Autor
Ortega-Vásquez, René Edgardo
Institución
Resumen
El Virus Diarrea Viral Bovina (VDVB) se encuentra diseminado en todo el mundo, con prevalencias serológicas que fluctúan entre un 50% y un 90% en el ganado bovino, constituyendo en una de las principales causas de pérdidas económicas en la industria del bovino, estimadasentre USD 10-57 millones 1 millón de terneros. En Chile, el virus se ha aislado desde bovinos que presentan una gran variedad de cuadros clínicos, detectándose aislados de los dos genotipos descritos del VDVB (VDVB 1 y VDVB2) y de cuatro subtipos del VDVBl (la, lb, 1i y lj) y uno del VDVB2 (2a).El propósito de esta tesis es determinar las bases genéticas de la virulencia de las cepas chilenas del VDVB. Con este objetivo, en una primera etapa se determinó la eficiencia replicativadel aislado nacional CH511 (genotipo lj) con respecto a virus nacionales de los otros subtipos presentes en el país y posteriormente, se estudió el posible rol de las regiones 5' NCR, 3' NCR,Ems, E2 y NS3 del genoma viral en la eficiencia replicativa de este virus.En el estudio de la eficiencia replicativa del virus CH511, se pudo establecer que los 2 virus analizados del subtipo lj (CH511 y CHl 087) presentaron una mayor eficiencia replicativa que los 2 virus analizados del subtipo 1 b (CH113 y CHl 025), en parámetros como duración del ciclo infectivo, rendimiento viral y pendientes en la curva de multiplicación de un paso. En cambio, los virus del subtipo 1 b tuvieron significativamente mayores pendientes que lj en la curva de múltiples pasos y una infección célula a célula más eficiente. Posteriormente, las regiones 5'NCR, 3 'NCR, Ems, E2 y NS3 del genoma de la cepa CH511 se secuenciaron y las secuencias nucleotídicas y aminoacídicas obtenidas se compararoncon las secuencias equivalentes de la cepa estándar NADL del VDVB y con los virus chilenos pertenecientes a los otros subtipos del VDVB, con el objetivo de identificar zonas genómicassospechosas de ser las responsables de las características replicativas de la cepa CH511. En este estudio, si bien se pudo encontrar diferencias nucleotídicas en las zonas 5' NCR y 3' NCR, la estructura secundaria de estas regiones, que seria determinante para su función, no se vería mayormente alterada. La región NS3 fue la más conservada y la región E2 fue la región más variable de las zonas analizadas. La región codificante para la glicoproteína E2, quecorresponde al receptor viral, es una de las proteínas más importantes del virus y por lo tanto es probable que algunas de las diferencias aminoacídicas encontradas entre virus de distintos subtipos, puedan ser las responsables de las diferencias detectadas en la eficiencia replicativa y en la diseminación célula a célula. Por último, esta tesis también pudo establecer que la glicoproteína Ems presentó una mutación aminoacídica en el sitio activo de la actividad RNasa dela proteína (Y349H) en ambos virus pertenecientes al subtipo lj, lo que prácticamente eliminó su actividad enzimática, lo que podría tener incidencia sobre la evasión de la respuesta inmune que induce esta proteína en el VDVB. PFCHA-Becas Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias 164p. PFCHA-Becas TERMINADA