This research identifies and assesses the level of chemical and biological risks to which workers of Provincial Decentralized Autonomous Government of Cotopaxi are exposed, using qualitative-quantitative evaluation methods endorsed by the National Institute of Safety and Occupational Health in Spain, with the aim of documenting the presence of risks, levels are and determine the checkpoints. Research based on the regulations of legal texts that govern the occupational safety and health, applicable to all public and private institutions, determining that moderate chemical risk for workers of workshops and a biological intervention level for N1H1 virus exist. The methodology applied is bibliographic documentary, field and observation; the type of research is a feasible project. The results were to design a procedure manual for chemical and biological risks, allowing this institution to comply as provided for in the legislation on health and safety.Esta investigación identifica y evalúa el nivel de riesgos químico y biológico a los que están expuestos los trabajadores del Gobierno Autónomo Descentralizado Provincial de Cotopaxi, se utilizó métodos de evaluación cuali - cuantitativos avalados por el Instituto Nacional de Seguridad e Higiene del Trabajo de España, con la finalidad de documentar la presencia de riesgos, en que niveles se encuentran y determinar los puntos de control. La investigación se fundamenta en la normativa contenida en los cuerpos legales que rigen el campo de la seguridad y salud en el trabajo, aplicable a toda institución pública y privada, donde se determina que existe riesgo químico moderado para el grupo de trabajadores de talleres y un nivel de intervención biológica para el virus N1H1. La metodología aplicada es bibliográfica documental, de campo y de observación; el tipo de investigación es un proyecto factible. Con los resultados obtenidos se procedió al diseño de un manual de procedimientos para riesgos químico y biológico, que le permita cumplir a esta institución pública con lo dispuesto en la legislación en materia de seguridad y salud.