This paper draws from scientifc data, especially in biology and neurosciences, some insights to analyze the way transsexuality manifests itself in teenagers. Accordingly, we explore out some aspects of how the transsexual identity is formed in adolescence. We show also how sexual differentiation based on transsexuality is the motive for discrimination and violence in the school system. We try to identify some way such a system operates against and excludes transsexuals. At the end of this paper we include a summary of protocols for intervention in search of protection and promotion of the human rights of these persons. We review several studies on the case of Costa Rica between the years 2008 to 2016, and we note that there are no social researches on this important issue in the country.El artículo analiza cómo se presenta la transexualidad en las personas adolescentes, para lo cual se recurre a argumentos científicos, en especial de la biología y las neurociencias. Además, se estudian algunos aspectos de cómo se conforma la identidad transexual en la adolescencia. Por otra parte, se escruta cómo la diferencia sexual establecida por la transexualidad produce actos de discriminación y violencia en el sistema escolar. Se intentará determinar algunas formas en que el sistema educativo funciona, por lo general, como un sistema transfóbico, el que expulsa a los(as) adolescentes transexuales. Por último, se resumen algunos mecanismos y acciones que pueden conformar protocolos de intervención para proteger y favorecer los derechos humanos de estas personas. Se revisan varios estudios sobre el caso de Costa Rica entre los años del 2008 al 2016, y se señala que en el país no existen investigaciones sociales sobre este importante tema.