Tesis
Variabilidad genética y relación filogeográfica de subespecies de venado Cola Blanca (Odocoileus virginianus) en la región Golfo de México.
Autor
ORTIZ CONTLA, HECTOR; 209183
Ortiz Contla, Héctor
ORTIZ CONTLA, HECTOR
Institución
Resumen
Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Ganadería).- Colegio de Postgraduados, 2015. El venado cola blanca presenta distribución en Norte, Centro y Sur América, en México se distribuyen históricamente 14 de las 38 subespecies reportadas, y aunque solo dos tienen importancia cinegética, todas las subespecies son aprovechadas para diferentes fines. A pesar del rol tan importante del venado cola blanca en México, no se tiene suficiente información acerca de la diversidad genética de la especie. El objetivo de la presente investigación fue determinar y describir la variabilidad genética de las subespecies O. v. texanus, O. v. veraecrucis, O. v. thomasi y O. v. yucatanensis con distribución en la zona del Golfo de México por medio del uso de un fragmento de la región control (D-Loop) del ADN mitocondrial. Se recolectaron 47 muestras de tejido muscular, cartílago auricular u órganos; 16 de O. v. texanus, 17 de O. v. veraecrucis, 4 de O. v. thomasi y 10 de O. v. yucatanensis y se identificaron 46 haplotipos. Las relaciones filogeográficas fueron determinadas con los métodos Neighbor-Joining y máxima verosimilitud con secuencias del fragmento de 468 pares de bases. La estructura genética y variabilidad se calcularon por medio de Análisis de Varianza Molecular (AMOVA), los índices de diversidad haplotípica (h) y nucleotídica (π). La relación filogeográfica concuerda por ambos métodos donde las secuencias divergen a partir de O. v. yucatanensis. A partir de los Análisis de Varianza Molecular se definió diferenciación genética entre las subespecies en estudio (FST= 0.19781, P<0.05). Los niveles de los índices h (0.9979) y π (0.15129) sugieren niveles moderados de variación genética. Se realizó una red de haplotipos que vinculó a las subespecies O. v. texanus y O. v. veraecrucis, las subespecies restantes no presentaron vinculación, ni dentro ni entre subespecies. _______________ GENETIC VARIABILITY AND PHILOGEOGRAPHIC RELATION OF WHITE-TAILED DEER (ODOCOILEUS VIRGINIANUS) SUBSPECIES IN THE GULF OF MEXICO REGION. ABSTRACT: White-tailed deer is found in North, Central and South America, in Mexico there are 14 out of the 38 known subspecies, all mexican subspecies are of some use by local people and two of them are international-trophy rank; despite the importance of white-tailed deer in México, information on genetic divesity of this species is scarce. The objective of the study was to determine and describe genetic variability of O. v. texanus, O. v. veraecrucis, O. v. thomasi and O. v. yucatanensis subspecies distributed in the Gulf of Mexico area by means of the use of a mitocondrial ADN fragment from the control region (D-loop). The study was based on 47 samples either of muscle tissue, ear cartilage or internal organ tissue; samples sorted by subspecies were: 17, 16, 10 and 4 of O. v. veraecrucis, texanus, yucatanensis and thomasi, respectively. There were 46 different haplotypes. Neighbor-Joining and maximum likelihood were used to determine philogeographic relations based on sequences of the fragment of 468 pairs of bases. Genetic structure and variability were calculated by Molecular analysis of variance (AMOVA), indices of haplotype diversity (h) and nucleotide (π). Both methods gave the same philogeographic relations, sequences differ from O. v. yucatanensis. Subspecies genetic diferentation was defined from Molecular analysis of variance, FST= 0.19781 (P<0.05). Index values of 0.9979 and 0.15129 for h and π, respectively, allow to indicate a moderate genetic variation. Haplotype net showed some relationship between O. v. texanus and O. v. veraecrucis subspecies, no within and among subspecies realtions were found among the other subspecies. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT).