Una metodología para la identificación del patrón de dímeros de ADN en genes que determinan halotolerancia

Abstract

ABSTRACT: Tbe present thesis to obtain the degree of Master in Sciences in Methodology of. Science is about twO types of findings oc productions of knowledge: a) The empirical findings obtained by the analysis and Ihe observation and but specifícally in this case by the identification of patterns of the halotolerance genes. b) The methodologic findings of the state of the art that not only by a bibliographical revision but by the analysis of the proposed theones that corinect the halotolerance with different types stress and everil with the geological differences with respect to the abundance of NaCI in the planet. Within the empirical findings it was found: 1) A determined pattem in the halototerance genes which is completely different from the pattems of another type of studied genes up to date. 2) The high frequency of the DNA duplex TT in genes that determine halotolerance independently of taxa or complexity the organisrn that had the gene that determines the analyzed halotolerance. The high frequency of DNA duplex TT was observed in ah the genes that were used for this work independently of their type (except for determining halotolerance). 3) The Ohno's Rule is not always fulfihled in the analyzed genes, being observed in 16 S RNA genes belonging this to organisms evolutively primitivo (Archeae, Protobacterias, Cyanobacterias). 4) It was observed a high frequency of 16 ARN of S hike genetic material in the genes that determine halotolerance. As result of the methodological work of this is proposed Ihe Halotoherance is more that an adaptation to sahine stress, it repcesents the form more prirnitive of ¡¡fe on Earth reason why is suggested that (he evolutionanly prirnitive genes couhd be those that alhow the halotolerance and the halophihism. All these things allow to suppose: the existence of two types of halotolerance: a) Halotolerance por se Ihat appears in unicehtuhar organisms hike sorne bacteria, in sorne unicellular seaweed, sorne unicellular eucanotes and part of the Archeae Kingdom. And b) Apparent Halotolerance that is present in pluricellular organisms with the presence of systems that only eliminate the excesses of salt. In the case of pluricellular (makers of tissues that uve in conditions of satine stress) it is possible to say that they are en adaptation to the enviroment, by means of specialized tissues in ehirninating the NaCI the halotolerance and the halophihism are possible by means of different strategies like: Storage ceil of Salts, Succulent, Regulator of salts, Fast Growth, particularly in vegetables. In agreement with the proposals of the hypothesis (a) and the definitions it is deduced that the first type of Halotolerance on Earth according to the analyzed evidence was the Halotolerance por se, own of unicehlular organisms.

RESUMEN: En la presente tesis para obtener el grado de Maestro en Ciencias en Metodología de la Ciencia se encuentran dos tipos de hallazgos o producciones de conocimiento: a) Los hallazgos empíricos logrados por el análisis y la observación y más específicamente en este caso, la identificación de patrones de los genes de hatotolerancia. b) Los hallazgos metodológicos del estado del arte que no solamente está constituido por una revisión bibliográfica sino por el análisis de las teorías propuestas que conectan la halotoíerancia con diferentes tipos de estrés y hasta con las diferencias geológicas respecto a la abundancia de Cloruro de Sodio en el planeta. En los hallazgos empíricos se pueden mencionar 1) La detección de un patrón determinado en los genes de halotoleraricia lo cual es completamente diferente de los patrones de otro tipo de genes estudiados a la fecha. 2) La alta frecuencia del dímero iT en genes que determinan halotolerancia independientemente de la taxa o complejidad 'del organismo que poseyese al gen que determina halotolerancia analizado. La alta frecuencia del dímero TT se observó en todos los genes que se utilizaron para este trabajo independientemente de su tipo (salvo determinar halotolerancia). 3) La Regla de Ohno (Disminución de los dímeros TA y CG por aumento de los dímeros TG, CA y CT) en ocasiones no se cumplió siempre en los genes analizados, observándose lo anterior en genes ARN de 16 S pertenecientes a organismos evolutivamente más primitivos (Archeae, Protobacterias, Cyanobactenas). - 4) Se observó una alta frecuencia de ARN de 16 S como material genético en los genes que determinan halotolerancia. Como resultado del trabajo metodológico de esta tesis se propone que la Halotolerancia más que una adaptación al estrés salino, representa la forma de vida más primitiva en la Tierra por lo que se propone que los genes evolutivamente más primitivos pudieran ser los que permiten la halotolerancia y el halofulismo. Lo anterior permite proponer La existencia de dos tipos de halotolerancia: a) La Halotolerancia por ser actualmente presente en organismos unicelulares como algunas bacterias, en algunas algas unicelulares, algunos eucariotes unicelulares y parte del Reino Archeae. b) La Halotolerancia aparente presente en organismos pluricelulares con la presencia de sistemas que solamente eliminen los excesos de sal. En el caso de organismos pluricelulares (formadores de tejidos que viven en condiciones de estrés salino es posible decir que son una adaptación al ambiente, por medio de tejidos especializados en eliminar el NaCI) la halotolerancia y el haloflhismo son posibles mediante diferentes estrategias de estos organismos como: Acumulador de Sales, Suculencia, Regulador de sales, Crecimiento rápido, particularmente en vegetales. Y de acuerdo con las proposiciones de la hipótesis (a) y de las definiciones, se deduce que el primer tipo de Halotolerancia en existir, de acuerdo a la evidencia analizada fue la Halotolerancia perse, propia de organismos unicelulares.