El artículo analiza los métodos de elección de los titulares de organismos autónomos con carácter ciudadano, desde la perspectiva de la participación ciudadana, vecinal y comunal, como un elemento clave en la organización de las estructuras autónomas de gobierno, en donde existen varios casos en esta situación como los responsables de organismos autónomos en México. Con base en los principios de la Teoría Fundamentada se realizaron observaciones empíricas directas por medio de grupos de enfoque, valorando cualitativamente las estructuras de pensamiento orgánico, gubernamental y ciudadano, como un proceso de interacción entre ambos universos sociales.