Em qualquer procedimento de medição de uma grandeza o resultado trará diversas parcelas de dúvida quanto ao valor verdadeiro do mensurando. A norma NBR ISO/IEC 17025 define que os laboratórios atendam a procedimentos de cálculos de incertezas de medição a fim de validar ou confirmar os métodos. A partir desse disposto, este trabalho objetivou desenvolver e implementar cálculo de incerteza de medição em resultados de contagem de Bacillus Cereus em alimentos, utilizando o produto polenta congelada, assim como aplicar o Controle Estatístico de Processos (CEP). O cálculo foi desenvolvido baseado em documento de caráter orientativo do Inmetro e a ISO/TS 19036. Os cálculos foram aplicados aos dados de 10 amostras de polenta congelada de um mesmo lote de produção. A incerteza expandida obtida da análise dos resultados possibilitou a determinação de intervalos a partir da média de valores obtidos nas repetições que caracterizam que o valor verdadeiro da amostra está entre esses valores. Deste modo, foi possível verificar que amplitudes baixas entre os resultados implicam em incertezas baixas, o que é relevante para o estudo como garantia da qualidade dos ensaios. Concluiu-se a partir dos resultados que o CEP pode ser utilizado para viabilizar estudos de causas para possíveis falhas na operação das análises dentro da rotina diária, a qual demonstrou resultados satisfatórios determinando através do limite de controle deste tipo de produto, a alta qualidade com referência a parâmetros microbiológicos das amostras. Os procedimentos para atendimento do cálculo de incertezas se demonstrou adequado e de relativa facilidade de aplicação, constituindo-se um meio de garantia da qualidade do resultado para tomada de decisões fundamentadas.