Thesis
Identificación de potenciales dianas terapéuticas para el liquen plano oral usando herramientas de bioinformática
Autor
Peña Aliaga, Carolina
Pérez González, Mariangela
Rivera Martínez, César Andrés (Prof. Guía)
Institución
Resumen
82 p. El liquen plano oral (LPO) es una enfermedad mediada inmunológicamente que resulta en una agresión a los queratinocitos basales de la mucosa oral. Se considera incurable, existiendo terapias paliativas en base a corticoides. La inexistencia de un tratamiento
específico para la enfermedad puede deberse al conocimiento incompleto de su
etiopatogenia. Con el objetivo de comprender mejor los mecanismos inflamatorios específicos e inespecíficos del LPO y proponer nuevas alternativas terapéuticas, utilizamos un enfoque basado en redes para enfermedades humanas. Identificamos genes participantes
en el LPO a partir de 1.075.776 artículos utilizando el algoritmo Génie. Para interpretar el contexto biológico de los datos obtenidos, la lista de genes se analizó y enriqueció mediante el programa Cytoscape generando una red de interacciones proteína-proteína. Desde ella seleccionamos los centros de actividad más importantes (distribución hipergeométrica,valores-p≤0,05 corregidos por el método Benjamini-Hochberg). Denominamos a este grupo el interactoma del LPO. Utilizando la base STITCH descubrimos que este interactoma
representa una comunidad biológicamente conectada (coeficiente de agrupación de 0,97), destacando dos proteínas y eventuales dianas terapéuticas para plerixafor, el factor 1 derivado de células estromales (CXCL12) y el receptor de quimioquinas C-X-C tipo 4 (CXCR4). Mediante herramientas de bioinformática nuestra investigación permitió predecir
un grupo de proteínas involucradas en la patogenia del LPO. Futuras investigaciones deben verificar y validar nuestras predicciones. Palabras clave: liquen plano oral, interacciones proteína-proteína, CXCL12, CXCR4, plerixafor.