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Deep learning para classificação hierárquica de elementos transponíveis
(Universidade Federal de São CarlosUFSCarPrograma de Pós-Graduação em Ciência da Computação - PPGCCCâmpus São Carlos, 2018-09-05)
Transposable Elements (TEs) are DNA sequences that can change its location within a cell's genome. They contribute directly to the genetic variety of species. Besides, their transposition mechanisms can affect the functionality ...
Dinâmica evolutiva de elementos de transposição nas espécies irmãs Rhodnius robustus e R. prolixus
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2019-02-22)
Os elementos de transposição (TEs) são sequências repetitivas amplamente distribuídas nos genomas que representam importantes fontes geradoras de variabilidade genética. As características genômicas derivadas de sua ...
Anotação e caracterização de elementos de transposição no genoma de Drosophila mojavensis e de sua espécie irmã D. arizonae
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2019-02-22)
Elementos de transposição (TEs) são sequências de DNA repetitivas capazes de se moverem a partir de um local para outro no genoma e a capacidade replicativa dessas sequências é a essência de seu sucesso evolutivo. O presente ...
Caracterização de pequenos RNAs não-codificantes (microRNAs e PIWI-interacting RNAs) na presença do cromossomo B do ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2022-02-18)
Os supranumerários cromossomos B são elementos extras ao genoma encontrados em diversas espécies de eucariotos, desde fungos, plantas a animais. A origem independente nos mais diversos organismos também reflete a sua ...
Análise da ocorrência de transposição em regiões reguladoras dos genes da família Cyp em espécies de Drosophila
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2009-04-27)
A resistência aos inseticidas é um modelo de processo evolutivo onde o inseticida atua como agente seletivo e, como resposta à seleção, ocorre a evolução da resistência nas populações de insetos. As enzimas citocromo P450 ...
Elementos de transposição no gênero Zaprionus (Diptera, Drosophilidae): estudos genômicos e evolutivos em ênfase nos retrotensposons copia, gypsy e micropia
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2009-03-06)
O gênero Zaprionus tem sido eleito como um bom modelo biológico para estudos genéticocomparativos com as espécies do subgrupo melanogaster do gênero Drosophila, embora seu posicionamento filogenético dentro da família ...
Algoritmos genéticos multiobjetivo para classificação hierárquica de elementos transponíveis
(Universidade Federal de São CarlosUFSCarPrograma de Pós-Graduação em Ciência da Computação - PPGCCCâmpus São Carlos, 2018-11-09)
In Machine Learning (ML), commonly a classification problem consists of associating an instance to only one class within an usually small number of classes. However, there are more complex problems involving dozens and ...
Elementos de transposição como fonte de novidades genéticas em nível transcricional: uma abordagem computacional e molecular
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2011-02-25)
Elementos de transposição (TEs) são entidades genéticas que podem ter profundos impactos, estrutural, funcional, intra e interespecíficos na evolução dos genomas. A contribuição dos TEs para formação de novas seqüências ...
Evolution of multigene families in species with large genomes using Schistocerca grasshoppers as models
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2021-10-04)
As famílias multigênicas são componentes essenciais dos genomas eucarióticos e desempenham papéis-chave tanto estrutural como funcional. Seus modos de evolução permanecem elusivos mesmo na era da genômica, pois múltiplas ...
DNAs satélites e evolução do sistema sexual neo-XY do gafanhoto Ronderosia bergii: uma abordagem citogenômica
(Universidade Estadual Paulista (Unesp), 2020-02-17)
Uma característica comum da evolução dos cromossomos sexuais é a acumulação de DNAs repetitivos, que estão envolvidos em sua diversificação e degeneração. Em gafanhotos o sistema ancestral dos cromossomos sexuais é o XO, ...