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Mostrando ítems 1-10 de 217
Taxonomic assignment of 16S rRNA sequences based on Fourier analysis
(Universidad de los AndesMaestría en Biología ComputacionalFacultad de CienciasDepartamento de Biología, 2016)
We introduce TAXOFOR a novel machine learning classifier using Random Forests to assign taxonomy to paired-end sequencing amplicons up to genus level, trained with annotated sequences from the Green-Genes database. It ...
A Recurrent Neural Network approach for whole genome bacteria classification
(2018-09)
The classification of bacteria plays an essential role in multiple areas of research. Those areas include experimental biology, food and water industries, pathology, microbiology, and evolutionary studies. Although there ...
Estimating the andean bear diet through DNA metabarcoding and its relationships to the gut microbiome
(Universidad de los AndesMaestría en Biología ComputacionalFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicas, 2021-12-13)
The Andean or spectacled bear, Tremarctos ornatus, is an endemic species of the tropical Andes and it is catalogued as Vulnerable by the International Union for the Conservation of Nature (IUCN). The methodologies to ...
Phylogenetic relationships among the Caribbean members of the Cliona Viridis complex (Porífera, Demospongiae, Hadromerida) using nuclear and mitochondrial DNA sequences
(UniandesMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDepartamento de Biología, 2010)
A species complex is a group of closely related species, where intraspecific variability overlaps with interspecific variation. Frequently, members of a species complex do not have complete reproductive isolation, therefore, ...
Community changes in vertebrate composition in the Gulf of Tribugá, Colombia, based on eDNA analysis
(Universidad de los AndesMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicas, 2022-12-13)
In recent decades, advances in molecular techniques have given rise to a new biomonitoring tool known as environmental DNA (eDNA). With an efficient, non-invasive, and replicable sampling approach, eDNA is currently posited ...
Identificación de Genes de Lipasas Extracelulares en Candida Palmioleophila y su Relación con Genes Lip2 y Lip6
(Bucaramanga : Universidad de Santander, 2021Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y AgropecuariasBucaramanga, ColombiaMaestría en Biotecnología, 2021-08-24)
El objetivo del presente estudio fue identificar secuencias genéticas ortólogas de lipasas extracelulares LIP2 y LIP6 presentes en microorganismos modelo de Candida palmioleophila (Nakase&Itoh 8040), sin embargo, durante ...
Caracterización de la función de las enzimas Ten Eleven Translocation (TETs) humanas en la desmetilación del DNA inducida por altos niveles de glucosa
(Universidad de los AndesMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicas, 2018)
Introduction The process of DNA demethylation was found necessary for various processes, for example, the maturation of gametes and zygote. However, the underlying mechanisms to the demethylation were not known and for a ...
Buforin II-Escherichia coli's DNA interactome: Routes to elucidate the molecular mechanisms of its antimicrobial activity
(Universidad de los AndesMaestría en Ingeniería BiomédicaFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería Biomédica, 2021)
The increase of multi-resistant bacteria in the last decade has become a global health issue that requires the development of alternative treatments. Antimicrobial peptides are of great interest due to their high effectiveness ...
Modelamiento de la interacción entre una secuencia de ADN, como señuelo dirigido, con el blanco (HIF-1) mediante acoplamiento molecular
(2018-05-05)
Las células tumorales cancerosas son generadas por una desregulación de genes, que les permiten adquirir habilidades como proliferación incontrolable, resistencia apoptótica, aumento de procesos angiogénicos y evasión ...
Variabilidad genética de spongospora subterranea y su virus asociado pmtv en Colombia
(2012)
El cultivo de papa es uno de los renglones agrícolas de mayor importancia en Colombia; se extiende a 128.701 ha y genera una producción anual de 2.3 millones de ton año-1. Desde el punto vista fitosanitario, la papa se ve ...