Introducción. En la última década la influencia del capital humano en las organizaciones ha sido evidente. Este conjunto de mecanismos ha generado en las empresas un rendimiento superior que se evidencia en su sostenibilidad. El capital humano es un inductor de habilidades profesionales de desarrollo empresarial necesario para sustentar la productividad del factor humano y su crecimiento sostenido. Objetivo general. Analizar la influencia que ejerce el cuadro de mando integral en el capital humano de las instituciones de salud pública del Ecuador. Metodología. Por conducto de una encuesta en línea que fue respondida por una muestra representativa de 355 administrativos y médicos adscritos a la Coordinación Zonal 3 del Ministerio de Salud Pública del Ecuador. Este instrumento fue estructurado por una escala de medición del control de gestión y de medición del capital humano. Las variables se fundamentaron usando deducción hipotética y análisis histórico lógico. Resultados. Se evidencia una relación entre las variables: control de gestión y capital humano dentro de las instituciones de salud pública. Conclusiones. Por su tipificación de organización estatal existe un nivel aceptable de control de gestión, sin embargo, un nivel de desarrollo de capital humano deficiente. Se hace un extensivo un agradecimiento a la Dirección de Investigación y Desarrollo de la Universidad Técnica de Ambato.Introduction. In the last decade, the influence of human capital in organizations has been evident. This set of mechanisms has generated superior performance in companies that is evident in their sustainability. Human capital is an inducer of professional business development skills necessary to sustain the productivity of the human factor and its sustained growth. General objective. Analyze the influence exerted by the balanced scorecard on the human capital of public health institutions in Ecuador. Methodology. Through an online survey that was answered by a representative sample of 355 administrators and doctors attached to Zonal Coordination 3 of the Ministry of Public Health of Ecuador. This instrument was structured by a scale for measuring management control and measuring human capital. The variables were founded using hypothetical deduction and logical historical analysis. Results. A relationship between the variables is evident: management control and human capital within public health institutions. conclusions. Due to its classification as a state organization, there is an acceptable level of management control, however, a deficient level of human capital development.