Trabalho de Conclusão de Curso
Estudos de planejamento de ecdiesteróisdes com ação analgésica potencial: docking molecular e de farmacóforo
Design studies of ecdysterols with potential analgesic action: molecular and pharmacophore docking
Registro en:
FERNANDES, Mariana Sabo. Estudos de planejamento de ecdiesteróisdes com ação analgésica potencial: docking molecular e de farmacóforo. 45 p. Trabalho de conclusão de curso (graduação) - Universidade Federal do Pampa, Graduação em Farmácia, 2018.
Autor
Fernandes, Mariana Sabo
Institución
Resumen
The ecdysteroids are steroidal hormones present in almost all classes of arthropods and invertebrate phyla. They are analogous to phytoecdysteroids present in plants. Because of their structural similarity to human steroid compounds, many of these have hormonal or antinociceptive activity. Ecdysone is the precursor of the 20- hydroxyecysdone (20E) compound which, in turn, is an important steroid hormone that controls the embryonic development of the Arthropoda phylum. Studies report antinociceptive activity of plant extracts containing ecdysteroids. Due to this effect, it was proposed the planning and design of 60 compounds derived from 20E and the application of molecular modeling studies through molecular docking at the opioid receptors, and the study of pharmacophore. These studies were carried out in order to obtain models that allow the development of 20E derivatives with potential antinociceptive activity. The Spartan'08 software for Windows and quantum mechanics calculation methods AM1 and DFT / B3LYP with 6.31G * database were used for design, geometry optimization and conformational analysis of the compounds. The docking studies were performed using iGemdock 2.1 software. Opioid receptors μ (Mu-PDB ID: 4DKL), δ (Delta-PDB ID: 4EJ4), κ (Kappa-PDB ID: 4DJH) were downloaded from Protein Data Bank (PDB). A previous evaluation of the molecular docking allowed the selection of 12 compounds derived from 20E that may be acting with greater affinity at the opioid receptors. From this it is observed that the major interactions of the 20E derivatives at the Mu receptor occur with residues ASP-
147, HIS-297, LYS-303, TYR-148, LYS-233. At the Delta receptor at ASP-128 residues , TYR-308, TYR-129, TRP-274, TYR-308, and at the Kappa receptor at residues THR-171, ALA-175, PHE-169 and LYS-174. These data are in agrément with the literature, the interaction of these amino acid residues with the 20-hydroxyecysone compound at the Mu receptor. The pharmacophore model
presented sites of hydrophobic interaction in specific spatial region that allowed its use in the selection of probable bioactive compounds. Os ecdisteróides são hormônios esteroidais presentes em quase todas as classes de artrópodes e filos invertebrados. São análogos aos fitoecdisteróides, presentes nas plantas. Devido a sua similaridade estrutural com compostos esteroides humanos, muitos destes apresentam atividade hormonal ou antinociceptiva. A ecdisona é a precursora do composto 20-hidroxiecdisona (20E) que, por sua vez, é um importante hormônio esteróide que controla o desenvolvimento embrionário do filo Arthropoda. Estudos relatam atividade antinociceptiva de extrato de plantas contendo ecdisteróides. Em virtude a este efeito foi proposto o planejamento e desenho de 60 compostos derivados do 20E e a aplicação de estudos de modelagem molecular
através de docking molecular nos receptores opióides, e o estudo de farmacóforo. Estes estudos ocorreram para fins de obtenção de modelos que permitam desenvolver compostos derivados do 20E com atividade antinociceptiva potencial. O software Spartan'08 para Windows e métodos de cálculo de mecânica quântica AM1 e DFT/B3LYP com base de dados 6.31G* foram utilizados para desenho, otimização de geometria e análise conformacional dos compostos. Os estudos de docking foram realizados com o emprego de software iGemdock 2.1. Os receptores opióides μ (Um - PDB ID: 4DKL), δ (Delta - PDB ID: 4EJ4), κ (Kappa - PDB ID: 4DJH) foram baixados do Protein Data Bank (PDB). Uma avaliação prévia do docking molecular permitiu a seleção de 12 compostos derivados do 20E que possam estar atuando com maior afinidade nos receptores opióides. A partir disto, observa-se que as principais interações dos derivados do 20E no receptor Mu ocorrem com os resíduos ASP – 147, HIS – 297, LYS – 303, TYR – 148, LYS – 233. No receptor Delta nos resíduos ASP – 128, TYR – 308, TYR – 129, TRP – 274, TYR – 308, e no receptor
Kappa nos resíduos THR – 171, ALA – 175, PHE – 169 e LYS – 174. Estes dados estão em concordância com a literatura, que aponta a interação destes resíduos de aminoácidos com o composto 20-hidroxiecdisona no receptor Mu. O modelo farmacóforo apresentou sítios de interação hidrofóbica em região espacial específica que permitiram seu uso na seleção de prováveis compostos bioativos.