Busca de fatores genéticos associados á leishmaniose mucosa em escala genômica utilizado microarranjos de dna
Registro en:
FELIPIN, Kátia Paula. Busca de fatores genéticos associados á leishmaniose mucosa em escala genômica utilizado microarranjos de DNA. 2017. 72 f. Dissertação (Mestrado ) - Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Fundação Universidade Federal de Rondônia, Porto Velho, 2017.
Autor
Felipin, Kátia Paula
Ferreira, Ricardo de Godoi Mattos
Institución
Resumen
Dissertação de mestrado apresentada ao
programa de Pós-Graduação em Biologia
Experimental, do Núcleo de Saúde, da
Universidade Federal de Rondônia – UNIR,
como requisito para obtenção do título de Mestre
em Biologia Experimental.
Orientador: Dr. Ricardo de Godoi Mattos Ferreira A leishmaniose tegumentar é uma doença infecciosa causada por parasitos protozoários do
gênero Leishmania, sendo considerada uma doença de difícil entendimento, podendo gerar
uma diversidade de aspectos clínicos. A distribuição dessa doença a tornou um problema de
saúde pública mundial afetando diversos países. A leishmaniose tegumentar tem amplo
espectro clínico variando de lesões de pele, únicas ou múltiplas, localizadas principalmente
em áreas descobertas do corpo, à lesões mucosas, que são consideradas uma evolução clínica
da doença a partir das lesões cutâneas. Os fatores que contribuem para o agravamento da
lesão cutânea inicial parecem dependentes da espécie do parasita envolvida e de fatores
genéticos e imunológicos do hospedeiro. O presente trabalho propôs avaliar aspectos
genéticos do hospedeiro associados ao fenótipo clínico da leishmaniose mucosa, pela busca de
polimorfismos (Single Nucleotide Polymorphism - SNP) que possam estar relacionados com o
agravamento da doença, utilizando uma plataforma robusta, com capacidade de analisar
simultaneamente 262 mil sítios distribuídos por todo o genoma humano. O estudo é do tipo
caso – controle, com um grupo de 30 amostras de pacientes com lesão mucosa (caso) e um
grupo com 29 amostras de pacientes com lesão cutânea (controle). Foi realizada a leitura de
69 chips e, 59 chips foram considerados aptos para prosseguir com a análise tendo como base
as métricas QC. Desses, 30 chips foram de amostras provenientes de pacientes com lesão
mucosa e, 29 chips de amostras provenientes de pacientes com lesão cutânea. Os testes de
associação entre os SNPs e os fenótipos foram realizados utilizando o pacote PLINK. Para
observar os resultados de maneira global, foi utilizado o gráfico de Manhattan Plot. Na
análise utilizando a abordagem GWAS não foram observadas associações significantes
considerando nível de significância determinado pela aplicação da correção de Bonferroni.
Considerando que a correção de Bonferroni é reconhecidamente conservadora, foram
analisados os 15 SNPs com maior indicação de associação com o fenótipo abordado. Desses,
foi possível listar três possíveis genes candidatos relacionados com a evolução da
leishmaniose tegumentar (C20orf85, GRM8 e PCLO). No cromossomo 4, foram identificados
três SNPs em posições bem próximas e, numa região adjacente a esses foram descritos quatro
genes relacionados com a resposta imune em infecções pelo parasito Leishmania, tornando
esses polimorfismos sugestões para trabalhos futuros.