Ministério da Educação e Universidade Federal Rural da AmazôniaOs estudos envolvendo comunidades zooplanctônicas e sua relação com os ecossistemas tropicais é uma difícil tarefa, devido a grande diversidade de fatores naturais ou antrópicas que influenciam nos processos ambientais. Contudo, o presente trabalho visa realizar a caracterização ambiental do estuário estudado, através da análise das variáveis físico-químicas da água, bem como caracterizar a distribuição dos organismos zooplanctônicos nesse ambiente, a partir de sua identificação e quantificação. Foram realizadas coletas bimestrais durante um ciclo hidrológico, nas quatro estações de amostragem, em suas variações de maré (enchente e vazante) e também coletas nictemerais em dois períodos sazonais, para a qual utilizou-se apenas um ponto fixo. As coletas foram realizadas através de arrastos horizontais na superfície da coluna d’água, utilizando-se rede de plâncton (abertura de malha de 200µm) e em seguida conservadas em formol a 4%, neutralizada com tetraborato de sódio. Parâmetros físico-químicos (temperatura, pH, salinidade, oxigênio dissolvido e condutividade elétrica) foram aferidos in situ, com sonda multiparamétrica simultaneamente às coletas biológicas. Em laboratório, a identificação das amostras qualitativas foi realizada a menor nível taxonômico possível. A partir das análises quantitativas, determinou-se a densidade (org.m3) dos diferentes grupos identificados e calculou-se a abundância relativa e a freqüência de ocorrência dos mesmos. A diversidade, equitabilidade e dominância na distribuição dos organismos foram estimadas pelos índices de Shannon-Wiener (H’), Pielou (J’), Berger-Parker respectivamente. Foram realizados testes de normalidade e significância entre os dados disponíveis nas duas campanhas. A Análise de Componentes Principais (PCA) e Análise de Agrupamento Hierárquico (HCA) foram feitas visando avaliar a relação existente entre os dados disponíveis. As variáveis ambientais não apresentaram grandes variações no período de estudo. As espécies consideradas muito frequentes durante todo o estudo foram as larvas de Polychaeta, Gastropoda, Bivalve e de Cirripedia, os náuplios de Copepodas, Acartia tonsa, Parvocalanus crassirostris, Paracalanus nanus, Paracalanus sp, Pseudodiaptomus sp1, Oithona nana, Cyclops sp, Cyclopoida, Calanoida, Harparcticoida, Poecilostomatoida. Os Copepodas foram os mais abundantes no estudo espaço-temporal, apresentando tendência de domínio, enquanto que no estudo nictemeral houve destaque para o grupo dos Cirripédia no período seco. As densidades mais elevadas do estudo bimestral foram no mês Julho/12, cuja riqueza foi a menor registrada e no caso do estudo de variação circadiana, a maior densidade zooplanctônica foi verificada no período seco e dos Calanoida no período chuvoso. Nos estudos bimestrais e nictemerais a diversidade específica apresentou padrão semelhante. Não houve diferença estatisticamente significativa no que diz respeito à comparação entre as densidades do período seco e do período chuvoso, bem como não houve entre os dados de temporalidade, espacialidade e regime de maré. A Análise de Cluster aplicada aos grupos zooplanctônicos do estudo bimestral permitiu identificar três agrupamentos formados de acordo com a similaridade entre suas distribuições. Já na análise do estudo nictemeral, aplicada aos horários de coleta, foi observada a separação das amostras por períodos sazonais (seco e chuvoso). Nas análises de PCA foi possível observar influência das variáveis ambientais nas campanhas bimestrais e da sazonalidade nas campanhas nictemerais.Studies involving zooplanktonic communities and their relationship with tropical ecosystems is a difficult task due to the great diversity of natural or anthropogenic factors that influence environmental processes. However, the present work aims to perform the environmental characterization of the studied estuary, through the analysis of the physico-chemical variables of water, as well as characterize the distribution of zooplanktonic organisms in this environment, from its identification and quantification. Samples were collected every two months for a hydrologic cycle, the four sampling stations in its tidal variations (ebb and flow) as well as collections Diel two seasonal periods, for which was used only a fixed point. The samples were collected by horizontal trawls on the surface of the water column using a plankton net (200μm mesh) and then preserved in 4% formalin, neutralized with sodium tetraborate. Physical-chemical parameters (temperature, pH, salinity, dissolved oxygen and electrical conductivity) were measured in situ, with a multiparametric probe simultaneously to the biological collections. In the laboratory, the identification of qualitative samples was performed at the lowest possible taxonomic level. From the quantitative analyzes, the density (org.m3) of the different groups identified was determined and the relative abundance and the frequency of their occurrence were calculated. Diversity, equitability and dominance in the distribution of organisms were estimated by the Shannon-Wiener (H '), Pielou (J') and Berger-Parker indices, respectively. Tests of normality and significance were performed between the data available in the two campaigns. The Principal Component Analysis (PCA) and Hierarchical Grouping Analysis (HCA) were performed to evaluate the relationship between available data. The environmental variables showed no significant variations during the study period. The species considered very common throughout the study were the larvae of Polychaeta, Gastropoda, Bivalve and barnacle, the nauplii of copepods, Acartia tonsa, Parvocalanus crassirostris, Paracalanus nanus, Paracalanus sp, Pseudodiaptomus sp1, Oithona nana, Cyclops sp, Cyclopoida, Calanoida, Harparcticoida, Poecilostomatoida. The copepods were the most abundant in the study space-time, with domain trend, while in the diurnal study was highlighting the group of cirripedia in the dry period and Calanoida in the rainy season. The highest densities of the bimonthly study were in July / 12, whose richness was the lowest recorded and in the case of the study of circadian variation, the highest zooplankton density was verified in the dry period. In the bimonthly and nictemeral studies the specific diversity presented a similar pattern. There was no statistically significant difference between the densities of the dry period and the rainy season, as well as between the data of temporality, spatiality and tidal regime. The Cluster Analysis applied to the zooplankton groups of the bimonthly study allowed to identify three clusters formed according to the similarity between their distributions. In the analysis of the nictemeral study, applied to the collection schedules, it was observed the separation of the samples by seasonal periods (dry and rainy). In the PCA analyzes, it was possible to observe the influence of the environmental variables in the bi-monthly campaigns and the seasonality in the nictemeral campaigns.