Functional foods have obtained increased interest in last years, as they provide nutritional support and meet physiological demands that provide additional health benefits. The objective of this work was to obtain flours from níger and cártamo seeds, to used them in different amounts for the elaboration of cookies, replacing the whole meal. Regarding the amount of flour used to elaborate the cookies, preliminary tests have been carried out, and a maximum of 50% w/w were then used. Seven formulations were tested: F1 (control); F2 (containing 25%w/w of cártamo flour); F3 (containing 50%w/w of cártamo flour) F4 (containing 50%w/w of cártamo flour and chocolate); F5 (containing 25%w/w of níger flour); F6(containing 50%w/w of níger flour); F7 (containing 50%w/w of níger flour and chocolate). The results show that the cookies made with níger and cártamo flour presents higher amounts of minerals, proteins and lipids. Samples containing 50% of cártamo flour obtained a higher index of acceptability than control samples.Os alimentos funcionais tem obtido destaque nos últimos anos, pois além de fornecerem suporte nutricional e atenderem demandas fisiológicas fornecem benefícios adicionais à saúde. O objetivo desse trabalho foi obter as farinhas de cártamo e níger aplicando-as nodesenvolvimento de formulações de biscoitos tipo cookies com diferentes percentuais de substituição à farinha de trigo integral. Para elaboração dos biscoitos tipo cookies realizou-se testes preliminares e foram estabelecidos percentuais máximos de substituição de 50%, foram elaboradas sete formulações: F1(controle); F2 (cártamo 25%) F3 (Cártamo 50% sem chocolate) F4 (cártamo 50% com chocolate); F5 (níger 25%); F6 (níger 50% sem chocolate); F7 (níger 50% com chocolate) Os resultados obtidos demonstraram que os cookies apresentaram maiores percentuais de minerais, proteínas e lipídios. As amostras contendo 50% de farinha de cártamo apresentaram índice de aceitabilidade maior do que as amostrascontrole.