Bovine cysticercosis is considered the main epidemic link of human taeniasis caused by Taenia saginata and responsible for great damage in the whole productive chain of meat. The aim of this study was to verify the species-specific molecular identity of bovine cysticerci classified into four stages of the process of host-parasite interaction. The cysticerci were collected during the bovine’s post mortem examination by the service of federal inspection in a slaughterhouse in the State of Goiás. Initially, the cysticerci were classified according to anatomopathological criteria. Subsequently, the PCR technique was applied using specific primers for the amplification of fragments of the Cysticercus bovis gene LSU RNAr. The results showed that PCR may be appliedin the species-specific identification of bovine cysticerci. The assertiveness in its results was larger in DNA samples from cysticerci classified in VS (Vesicular Stage) and CVS (Colloidal Vesicular Stage) in relation to the assertiveness in the results of PCR from DNA samples from cysticerci classified in GNS (Granular Nodular Stage) and CNS (Calcified Nodular Stage). The negativity in the PCR results was larger in DNA samples from cysticerci located in the heart and classified in GNS than the negativity from samples of the same cysticerci stage located in the mastication muscles.Introdução: A cisticercose bovina é considerada o principal elo epidemiológico da teníase humana provocada por Taenia saginata e ocasiona grande prejuízo em toda a cadeia produtiva da carne bovina. Objetivos: verificação espécie-especifica da identidade molecular de cisticercos bovinos classificados em quatro estágios do processo de interação parasito-hospedeiro. Métodos: os cisticercos foram coletados durante a inspeção post-mortem de animais sacrificados sob inspeção do serviço de inspeção federal num abatedouro do estado de Goiás. Inicialmente os cisticercos foram classificados de acordo com suas características anatomo-patológicas. Em seguida, a técnica de PCR foi aplicada utilizando-se primers específicos para amplificação do gene LSU RNAr de Cysticercus bovis. Resultados e conclusão: o PCR pode ser aplicado para a identificação espécie-especifica de cisticercos bovinos com assertividade maior (p<0,05) em amostras de cisticercos classificados no EV (estágio vesicular) e ECV (estágio coloidal vesicular) em relação à assertividade dos resultados de PCR de amostras de DNA de cisticercos nos EGN (estágio granular nodular) e ENC (estágio nodular calcificado). A negatividade dos resultados de PCR foi maior (p<0,05) nas amostras de DNA de cisticercos localizados no coração e classificados como EGN em relação à negatividade dos resultados de PCR de amostras de cisticercos do mesmo estágio e localizados em músculos masticatórios.