Análise comparativa in sílico de novos peptídeos derivados de proteínas imunodominantes de Toxoplasma gondii, com potencial para serem aplicados como ferramentas para o diagnóstico da toxoplasmose humana

In silico comparative analysis of novel peptides derived from Toxoplasma gondii immunodominant proteins as potential tools for the diagnosis of human toxoplasmosis

dc.contributorMineo, José Roberto
dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/2006638367304868
dc.contributorSantana, Silas Silva
dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/2742248161106428
dc.contributorNicolau Junior, Nilson
dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/0821186870496558
dc.creatorBetancourt, Angelis Del Valle Benitez
dc.date2022-10-04T18:26:18Z
dc.date2022-10-04T18:26:18Z
dc.date2022-05-27
dc.date.accessioned2023-09-28T21:05:58Z
dc.date.available2023-09-28T21:05:58Z
dc.identifierBETANCOURT, Angelis Del Valle Benitez. Análise comparativa in sílico de novos peptídeos derivados de proteínas imunodominantes de Toxoplasma gondii, com potencial para serem aplicados como ferramentas para o diagnóstico da toxoplasmose humana. 2022. 65 f. Dissertação (Mestrado em Imunologia e Parasitologia Aplicadas) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2022. DOI: http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.406
dc.identifierhttps://repositorio.ufu.br/handle/123456789/36230
dc.identifierhttp://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.406
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/9064030
dc.descriptionSerological tests for the diagnosis of Toxoplasma gondii infection have limitations in differentiating acute from chronic infection, which is important in determining the clinical management and treatment of pregnant women and immunocompromised individuals with toxoplasmosis. Here, an in silico analysis was performed to characterize immunogenic epitopes of SAG1, SAG2A, GRA1, GRA2, GRA3, GRA5, GRA6, GRA7, MAG1, BSR4, and CCp5A proteins that may emerge as alternatives to improve the diagnosis of toxoplasmosis. Once the protein sequences were retrieved from the Toxodb database, different parameters were calculated including physicochemical characteristics, accessibility values, and antigenicity. Multiple sequence alignment, 3D structure modeling, refinement, and validation were also performed among all 11 peptides. Considering the results from the combination of all parameters analyzed, it can be concluded that the peptides of SAG1, GRA3, and BSR4 proteins were found to be stable, hydrophilic, with significant antigenicity values, and accessibility on the protein surface. Thus, the use of these peptides may suggest alternative measures for the design and standardization of new immunodiagnostic assays for toxoplasmosis.
dc.descriptionDissertação (Mestrado)
dc.descriptionOs testes sorológicos para o diagnóstico da infecção por Toxoplasma gondii têm limitações para diferenciar a infecção aguda da infecção crônica, o que é importante para determinar o manejo clínico e o tratamento de mulheres grávidas e indivíduos imunocomprometidos com toxoplasmose. No presente estudo, foram realizadas análises in sílico para caracterizar epítopos imunogênicos das proteínas SAG1, SAG2A, GRA1, GRA2, GRA3, GRA5, GRA6, GRA7, MAG1, BSR4 e CCp5A, as quais podem emergir como novas alternativas para melhorar o diagnóstico da toxoplasmose. Uma vez que as sequências proteicas foram recuperadas do banco de dados Toxodb, diferentes parâmetros foram calculados, incluindo características físico-químicas, valores de acessibilidade e antigenicidade. Alinhamento de sequências múltiplas, modelagem de estrutura 3D, refinamento e validação também foram realizados entre todos os 11 peptídeos. Considerando os resultados obtidos da combinação de todos os parâmetros analisados, pode-se concluir que os peptídeos das proteínas SAG1, GRA3 e BSR4 foram considerados os mais promissores, por serem estáveis, hidrofílicos, com valores significativos de antigenicidade e acessibilidade na superfície da proteína. Portanto, a aplicação destes peptídeos pode ser caracterizada como boas alternativas para a padronização de novos ensaios de imunodiagnóstico para toxoplasmose.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.publisherUniversidade Federal de Uberlândia
dc.publisherBrasil
dc.publisherPrograma de Pós-graduação em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
dc.rightsAcesso Aberto
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/
dc.subjectToxoplasma gondii
dc.subjecttoxoplasmose
dc.subjectanalise in silico
dc.subjectpeptídeos
dc.subjectepítopos imunodominantes
dc.subjectimunodiagnóstico
dc.subjecttoxoplasmosis
dc.subjectimmunodiagnosis
dc.subjectin silico
dc.subjectpeptide predictions
dc.subjectimmunodominant epitopes
dc.subjectImunologia
dc.subjectCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::PARASITOLOGIA
dc.subjectCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA::IMUNOLOGIA APLICADA
dc.subjectImunologia
dc.subjectToxoplasma gondii
dc.subjectToxoplasmose
dc.subjectPeptídeos
dc.subjectSorodiagnóstico
dc.titleAnálise comparativa in sílico de novos peptídeos derivados de proteínas imunodominantes de Toxoplasma gondii, com potencial para serem aplicados como ferramentas para o diagnóstico da toxoplasmose humana
dc.titleIn silico comparative analysis of novel peptides derived from Toxoplasma gondii immunodominant proteins as potential tools for the diagnosis of human toxoplasmosis
dc.typeDissertação


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