Dissertação
Modelagem molecular de inibidores da enzima tirosinase
Registro en:
Autor
MARTINS, Lucas de Sousa
Institución
Resumen
The enzyme Tyrosinase (TYR), responsible for the catalysis of the early stages of
melanogenesis in various organisms, is described in some groups. Among those that
stand out: hyperpigmentation, melasma and skin cancer, in not melanoma forms and
malignant melanoma. In general, dysfunctions are treated with depigmenting agents,
TYR enzyme alerts. However, among them is the kojic acid (KA), marked side effects.
Such phenomena make a TYR a model of biological development of drug prototypes.
In the meantime, I investigated some TYR enzyme inhibitory genes, in particular AK
and analogous plants, as well as a Tropolone and some benzaldehyde derivatives,
structurally related to the natural substrates of TYR (L-Tyrosine and L-Dopa), as the
Molecular Docking, Molecular Dynamics (MD), and the Linear Interaction Energy (LIE)
method, used to calculate the free binding energy of the systems. Specifically
application of Molecular Docking defined the mode of binding of the inhibitors in the
TYR site, being possible to quantify how interactions occur in the systems. As the MD
simulations, they exhibited the effect of the enzyme with different inhibitors and how
they act when complexed with a TYR enzyme, using a copper dummy atom model.
Thus, the results obtained by LIE were concordant with the experimental results,
obtaining an R2 of 0.91 in a linear regression of LIE vs Experimental, and this allowed
to analyze how Tropolona, KA, MOL2 and MOL3 interactions with the important to the
active site of TYR. Thus, the results achieved at work contributed significantly to the
achievement of inhibition of the TYR enzyme, helping to combat the evils caused by a
cycle of melanin production in organisms. FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas A enzima Tirosinase (TYR), responsável pela catálise das etapas iniciais da
melanogênese em vários organismos, está relacionada a diversos problemas de
saúde de ordem cutânea em seres humanos. Dentre os quais destacam-se: a
hiperpigmentação, melasma e o câncer de pele, nas formas não melanômica e
melanoma maligno. Em geral, estas disfunções são tratadas com substâncias
despigmentantes cutâneas, baseadas na inibição da enzima TYR. Porém, muitas
destas substâncias onde destaca-se o ácido kójico (AK), apresentam efeitos colaterais
acentuados. Tais fatores tornam a TYR um interessante alvo biológico no
planejamento e desenvolvimento de protótipos à fármacos. Neste estudo, investigouse alguns potenciais inibidores da enzima TYR, em particular o AK e moléculas
análogas, assim como, a Tropolona e alguns derivados de benzaldeído, relacionados
estruturalmente aos substratos naturais da TYR (L-Tirosina e L-Dopa), utilizando as
técnicas de Docagem Molecular, Dinâmica Molecular (DM) e o método LIE (Linear
Interaction Energy), usado para calcular a energia livre de ligação dos sistemas.
Especificamente aplicação da Docagem Molecular definiu o modo de ligação dos
inibidores no sítio da TYR, sendo possível quantificar as interações ocorrentes nos
sistemas. As simulações por DM, exibiram o comportamento da enzima com
diferentes inibidores e a forma como esses agem quando complexados com a enzima
TYR, utilizando-se na simulação um modelo dummy atom de cobre. Sendo assim, os
resultados do LIE mostraram concordância com os resultados experimentais, obtendo
um R2 de 0,91 em uma regressão linear LIE vs Experimental, e isso possibilitou
analisar as estimativas energéticas por resíduo da enzima em relação aos inibidores,
onde percebeu-se que a Tropolona, AK, MOL2 e MOL3 fazem interações diretas com
resíduos importantes para o sítio ativo da TYR. Assim sendo, os resultados
alcançados neste trabalho contribuem de maneira significativa para a ciência a cerca
a inibição da enzima TYR, ajudando no combate aos males provenientes de
irregularidades no ciclo de produção de melanina nos organismos.
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