Early blight is one of the most important diseases of tomato and potato crops and its management relies heavily on fungicide sprayings. There is a worldwide concern on reducing the use of pesticides for food production, and biocontrol stands as an important strategy for plant disease control. Biocontrol trials with isolates of five different Clonostachys species against potato and tomato early blight were carried under greenhouse conditions. Nine isolates were selected in a preliminary screening where 20 isolates were tested for the biocontrol of potato early blight. Three biocontrol trials were carried out to confirm control efficacy of selected isolates against potato early blight. The best isolates were Clonostachys chloroleuca UCBV 07 and C. rosea UCBV 133, with mean disease control efficacy of 84 and 80% in three biocontrol trials. The survival of the isolates and their capacity to reduce the pathogen inoculum on crop debris was also evaluated. All nine Clonostachys isolates were able to colonize and survive on potato crop debris for at least three weeks even when artificially dried; they also caused a drastic reduction of pathogen sporulation. In a second experiment, the same isolates were tested against tomato early blight using conidial suspensions and crude metabolite extracts. All treatments with the crude extracts reduced the disease severity and provided better control efficacy than the conidial suspensions. Our study shows that biocontrol capacity is a common trait in Clonostachys and not restricted to C. rosea , and that secondary metabolites may play an important role in disease control by these fungi. This study offers valuable information for future works using Clonostachys spp. and their secondary metabolites on disease management. Keywords: Inoculum reduction. Secondary metabolites. Disease control.Pinta preta é uma das principais doenças nas culturas do tomate e batata e seu controle é realizado através de contínuas aplicações de fungicidas. Existe uma grande demanda mundial pela redução de pesticidas e por uma agricultura sustentável. O controle biológico é uma importante ferramenta no controle de doenças de plantas. Foram executados em casa de vegetação ensaios de biocontrole com isolados de cinco espécies de Clonostachys no controle da pinta preta da batata e tomate. Os isolados utilizados foram previamente testados em um ensaio preliminar com 20 isolados resultando na seleção de 9 isolados. Dois ensaios de confirmação foram executados e isolados das espécies C. chloroleuca (n=2), C. pseudochroleuca e C. rhizophaga apresentaram resultados significativos de redução da doença que variaram de 85.5 a 88.8% de eficácia de controle. A sobrevivência dos agentes de biocontrole assim como a sua capacidade de redução de inóculo em restos culturais também foi avaliada. Todos os agentes de biocontrole sobreviveram e colonizaram os restos culturais provenientes de plantas tratadas até mesmo quando submetidos a secagem artificial, resultando em uma drástica redução de inóculo do patógeno em todos os tratamentos. Em um segundo experimento, foram avaliados o biocontrole da pinta-preta do tomateiro com os mesmos isolados, e a eficiência dos extratos metabólicos destes no controle da pinta preta do tomate. Os tratamentos com os extratos brutos foram capazes de reduzir a severidade de doença em plantas de tomate e apresentaram eficácia superior quando comparados à aplicação com as suspensões dos isolados. Neste estudo, foi demonstrado que a capacidade de biocontrole de Clonostachys é também é exercida por outras espécies do gênero, não restrita apenas para C. rosea, e que seus metabólitos secundários podem constituir-se em importantes ferramentas no controle de doenças. Os resultados deste estudo fornecem importantes informações para futuros trabalhos envolvendo Clonostachys spp., assim como a utilização de seus extratos metabólicos para o controle de doenças. Palavras-chave: Inóculo inicial. Metabólitos secundários. Controle.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico