Subtypes of Native American ancestry and leading causes of death: Mapuche ancestry-specific associations with gallbladder cancer risk in Chile

Subtipos de ascendencia nativa americana y principales causas de muerte: asociaciones específicas de la ascendencia mapuche con el riesgo de cáncer de vesícula biliar en Chile

dc.contributorlorenzo@imbi.uni-heidelberg.de
dc.contributorGerman Federal Ministry of Education and Research (BMBF) [01DN15021]; Germany's Excellence Initiative of Heidelberg University; Ruprecht-Karls-Universitat Heidelberg; Deutsche Forschungsgemeinschaft; German Research Foundation (DFG) [LO 2061/1]; Biobank of University of Chile; USA NIH [GM053275]; National Institutes of Health, National Cancer Institute, Division of Cancer Epidemiology and Genetics (DCEG); Office of Research on Women's Health (ORWH)
dc.contributorkoshiol, Jill https://orcid.org/0000-0002-3832-6204
dc.contributorRuiz-Linares, Andres https://orcid.org/0000-0001-8372-1011
dc.contributorLorenzo Bermejo, Justo https://orcid.org/0000-0002-6568-5333
dc.contributorGallo, Carla https://orcid.org/0000-0001-8348-0473
dc.contributorGonzalez-Jose, Rolando https://orcid.org/0000-0002-8128-9381
dc.contributorferreccio, catterina https://orcid.org/0000-0001-6331-5534
dc.creatorBermejo, Justo Lorenzo
dc.creatorBoekstegers, Felix
dc.creatorSilos, Rosa Gonzalez
dc.creatorMarcelain, Katherine
dc.creatorBaez Benavides, Pablo
dc.creatorBarahona Ponce, Carol
dc.creatorMueller, Bettina
dc.creatorFerreccio, Catterina
dc.creatorKoshiol, Jill
dc.creatorFischer, Christine
dc.creatorPeil, Barbara
dc.creatorSinsheimer, Janet
dc.creatorFuentes Guajardo, Macarena
dc.creatorBarajas, Olga
dc.creatorGonzalez-Jose, Rolando
dc.creatorBedoya, Gabriel
dc.creatorBortolini, Maria Catira
dc.creatorCanizales-Quinteros, Samuel
dc.creatorGallo, Carla
dc.creatorLinares, Andres Ruiz
dc.creatorRothhammer, Francisco
dc.date2023-04-18T01:55:29Z
dc.date2023-04-18T01:55:29Z
dc.date2017
dc.date.accessioned2023-09-27T20:20:56Z
dc.date.available2023-09-27T20:20:56Z
dc.identifier1553-7404
dc.identifierhttps://repositorio.uta.cl/xmlui/handle/20.500.14396/2793
dc.identifier10.1371/journal.pgen.1006756
dc.identifierEX0CD
dc.identifier28542165
dc.identifierWOS:000402884800013
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8943786
dc.descriptionLatin Americans are highly heterogeneous regarding the type of Native American ancestry. Consideration of specific associations with common diseases may lead to substantial advances in unraveling of disease etiology and disease prevention. Here we investigate possible associations between the type of Native American ancestry and leading causes of death. After an aggregate-data study based on genome-wide genotype data from 1805 admixed Chileans and 639,789 deaths, we validate an identified association with gallbladder cancer relying on individual data from 64 gallbladder cancer patients, with and without a family history, and 170 healthy controls. Native American proportions were markedly underestimated when the two main types of Native American ancestry in Chile, originated from the Mapuche and Aymara indigenous peoples, were combined together. Consideration of the type of Native American ancestry was crucial to identify disease associations. Native American ancestry showed no association with gallbladder cancer mortality (P = 0.26). By contrast, each 1% increase in the Mapuche proportion represented a 3.7% increased mortality risk by gallbladder cancer (95% CI 3.1-4.3%, P = 6x10(-27)). Individual-data results and extensive sensitivity analyses confirmed the association between Mapuche ancestry and gallbladder cancer. Increasing Mapuche proportions were also associated with an increased mortality due to asthma and, interestingly, with a decreased mortality by diabetes. The mortality due to skin, bladder, larynx, bronchus and lung cancers increased with increasing Aymara proportions. Described methods should be considered in future studies on human population genetics and human health. Complementary individual-based studies are needed to apportion the genetic and non-genetic components of associations identified relying on aggregate-data.
dc.descriptionLos latinoamericanos son muy heterogéneos en cuanto al tipo de ascendencia nativa americana. La consideración de asociaciones específicas con enfermedades comunes puede conducir a avances sustanciales en el esclarecimiento de la etiología y la prevención de enfermedades. Aquí investigamos posibles asociaciones entre el tipo de ascendencia nativa americana y las principales causas de muerte. Después de un estudio de datos agregados basado en datos de genotipos de todo el genoma de 1805 chilenos mezclados y 639 789 muertes, validamos una asociación identificada con el cáncer de vesícula biliar basándonos en datos individuales de 64 pacientes con cáncer de vesícula biliar, con y sin antecedentes familiares, y 170 controles sanos . Las proporciones de nativos americanos se subestimaron notablemente cuando se combinaron los dos tipos principales de ascendencia de nativos americanos en Chile, originarios de los pueblos indígenas mapuche y aymara. La consideración del tipo de ascendencia nativa americana fue crucial para identificar asociaciones de enfermedades. La ascendencia nativa americana no mostró asociación con la mortalidad por cáncer de vesícula biliar (P = 0,26). Por el contrario, cada aumento del 1% en la proporción mapuche representó un aumento del 3,7% en el riesgo de mortalidad por cáncer de vesícula biliar (95% IC 3,1-4,3 %, P = 6x10(-27)). Los resultados de los datos individuales y los extensos análisis de sensibilidad confirmaron la asociación entre la ascendencia mapuche y el cáncer de vesícula biliar. El aumento de las proporciones mapuche también se asoció con una mayor mortalidad por asma y, curiosamente, con una disminución de la mortalidad por diabetes. La mortalidad por cánceres de piel, vejiga, laringe, bronquios y pulmón aumentó a medida que aumentaba la proporción aymara. Los métodos descritos deben considerarse en futuros estudios sobre genética de poblaciones humanas y salud humana. Se necesitan estudios complementarios basados en individuos para prorratear los componentes genéticos y no genéticos de las asociaciones identificadas basándose en datos agregados.
dc.formatapplication/pdf
dc.format23 páginas
dc.languageEnglish
dc.publisherPUBLIC LIBRARY SCIENCE
dc.relationPlos Genetics, vol.13 no.5 (2017)
dc.relationhttps://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006756
dc.rightsGreen Published, Green Submitted, gold
dc.rightsAcceso abierto
dc.sourcePlos Genetics
dc.subjectGenome-Wide Association
dc.subjectGenetic Ancestry
dc.subjectAfrican-Americans
dc.subjectUnited-States
dc.subjectIge Levels
dc.subjectLatinos
dc.subjectAsthma
dc.subjectMortality
dc.subjectDisease
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectAsociación Genómica
dc.subjectAscendencia Genética
dc.subjectAfroamericanos
dc.subjectEstados Unidos
dc.subjectNiveles de Ige
dc.subjectLatinos
dc.subjectAsma
dc.subjectMortalidad
dc.subjectEnfermedad
dc.subjectEpidemiología
dc.titleSubtypes of Native American ancestry and leading causes of death: Mapuche ancestry-specific associations with gallbladder cancer risk in Chile
dc.titleSubtipos de ascendencia nativa americana y principales causas de muerte: asociaciones específicas de la ascendencia mapuche con el riesgo de cáncer de vesícula biliar en Chile
dc.typeArtículo de revista


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