Chloroplast genome of Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) a species adapted to the hyper-arid conditions of the Atacama and Peruvian desert

Genoma del cloroplasto de Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) una especie adaptada a las condiciones hiperáridas del desierto de Atacama y Perú

dc.contributorwhuanca@uta.cl
dc.contributorConvenio de Desempeno Regional [UTA1795, UTA1799]; Programa Nacional de Innovacion Agraria (PNIA) [11115-P0048950000101, OGM 8]
dc.contributorContreras Díaz, Roberto https://orcid.org/0000-0002-5607-811X
dc.contributorFerro Mauricio, Ruben Dario https://orcid.org/0000-0002-1408-3340
dc.contributorHuanca-Mamani, Wilson https://orcid.org/0000-0003-2321-7416
dc.creatorCesar Chavez-Galarza, Julio
dc.creatorCardenas-Ninasivincha, Steffany
dc.creatorContreras, Roberto
dc.creatorFerro-Mauricio, Ruben
dc.creatorHuanca-Mamani, Wilson
dc.date2023-04-18T01:47:43Z
dc.date2023-04-18T01:47:43Z
dc.date2021
dc.date.accessioned2023-09-27T20:19:30Z
dc.date.available2023-09-27T20:19:30Z
dc.identifierhttps://repositorio.uta.cl/xmlui/handle/20.500.14396/2298
dc.identifier2380-2359
dc.identifier10.1080/23802359.2021.1997122
dc.identifierWU7OY
dc.identifier34778557
dc.identifierWOS:000716731900001
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8943146
dc.descriptionTillandsia landbeckii Phil. is a vulnerable species belonging to the terrestrial Bromeliaceae family; it is highly adapted to extremely hyper-arid conditions of the Atacama Desert and Peruvian deserts. In this study, we sequenced, assembled, and annotated its chloroplast genome. T. landbeckii chloroplast genome is 159,131 bp in length, containing a large single-copy region of 87,164 bp, a small single-copy region of 18,521 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,723 bp. The GC content of the chloroplast genome is 37.33%. It encodes a total of 132 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes and 8 rRNA genes. The phylogenetic tree indicates that T. landbeckii is placed within the Bromeliaceae family and has a close relationship with T. marconae with 100% support.
dc.descriptionTillandsia landbeckii Phil. es una especie vulnerable perteneciente a la familia terrestre de las Bromeliaceae; está altamente adaptado a las condiciones extremadamente hiperáridas del desierto de Atacama y los desiertos peruanos. En este estudio, secuenciamos, ensamblamos y anotamos su genoma de cloroplasto. El genoma del cloroplasto de T. landbeckii tiene una longitud de 159 131 pb y contiene una región grande de copia única de 87 164 pb, una región pequeña de copia única de 18 521 pb y un par de regiones repetidas invertidas de 26 723 pb. El contenido de GC del genoma del cloroplasto es del 37,33%. Codifica un total de 132 genes, incluidos 86 genes que codifican proteínas, 38 genes de ARNt y 8 genes de ARNr. El árbol filogenético indica que T. landbeckii se ubica dentro de la familia Bromeliaceae y tiene una estrecha relación con T. marconae con un 100% de respaldo.
dc.formatapplication/pdf
dc.format3 páginas
dc.languageEnglish
dc.publisherTAYLOR & FRANCIS LTD
dc.relationMitochondrial Dna Part B-Resources, vol.6 no.12 (2021) p. 3375 - 3377
dc.relationhttps://doi.org/10.1080/23802359.2021.1997122
dc.rightsgold, Green Published
dc.rightsAcceso abierto
dc.sourceMitochondrial Dna Part B-Resources
dc.subjectChloroplast Genome
dc.subjectTillandsia Landbeckii
dc.subjectAlgorithm
dc.subjectLomas
dc.subjectGenoma del Cloroplasto
dc.subjectTillandsia Landbeckii
dc.subjectAlgoritmo
dc.subjectLomas
dc.titleChloroplast genome of Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) a species adapted to the hyper-arid conditions of the Atacama and Peruvian desert
dc.titleGenoma del cloroplasto de Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) una especie adaptada a las condiciones hiperáridas del desierto de Atacama y Perú
dc.typeArtículo de revista


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