Dissertation
Avaliação da resistência aos antibióticos, a variabilidade genética e as relações clonais de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli produtoras de ESBL de cultura de vigilância de uma unidade de terapia Intensiva no Município do Rio de Janeiro
Registration in:
SEJAS, C. G. F. Avaliação da resistência aos antibióticos, a variabilidade genética e as relações clonais de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli produtoras de ESBL de cultura de vigilância de uma unidade de terapia Intensiva no Município do Rio de Janeiro. 2015. 91 f. Dissertação (Mestrado em Vigilância Sanitária)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2015.
Author
Sejas, Claudia Gladys Flores
Abstract
No ambiente hospitalar, principalmente em UTI, o aumento na incidência de micro-organismos multirresistentes é considerado um dos principais problemas no tratamento das infecções hospitalares e de saúde pública global. Uma das rotinas incluídas na prática hospitalar é o monitoramento de pacientes, através de culturas de vigilância nasais, orais e retais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a resistência aos antibióticos, a variabilidade genética e as relações clonais em isolados de K. pneumoniae e E. coli produtoras de ESBL. Setenta isolados de K. pneumoniae e 47 de E. coli foram obtidos através de culturas de vigilância de origem retal na admissão do paciente na UTI de um Hospital Federal no Rio de Janeiro, seguida por controle semanal, entre março de 2013 e março 2014. O perfil de susceptibilidade aos antibióticos (CIM) foi avaliado através do sistema automatizado VITEK II. Foram pesquisados os genes de resistência blaSHV-1, blaTEM-1, blaOXA-1, blaKPC-2, blaOXA-48, blaCTX-M-15, blaVIM, blaIMP e blaNDM-1 pela PCR e determinada a diversidade genética entre os isolados (ERIC-PCR). E. coli e K. pneumoniae apresentaram altos percentuais de resistência à cefepime (98% e 94%, respectivamente) e à ceftazidima (100% e 96%, respectivamente). Somente os isolados de K. pneumoniae demonstraram resistência a ertapenem (61%), imipenem (54%) e meropenem (43%). Em relação à ciprofloxacina, 69% e 28% dos isolados de K. pneumoniae e E. coli foram resistentes, respectivamente. Os genes blaSHV-1 (69%), blaTEM-1 (63%), blaCTX-M-15 (47%), blaOXA-1 (60%), blaKPC-2 (57%) e blaOXA-48 (16%) foram detectados em K. pneumoniae e apenas blaTEM-1 (49%), blaCTX-M-15 (39%) e blaOXA-1 (49%) em E. coli, entretanto blaVIM, blaIMP e blaNDM-1 não foram detectados nos isolados. Foram evidenciados, ainda, isolados de E. coli carreando até três diferentes genes e K. pneumoniae com até seis genes responsáveis pela produção de diferentes β-lactamases. A tipificação molecular indicou uma grande diversidade genética entre os isolados de K. pneumoniae (68 perfis ̸ 70 isolados ) e de E. coli (37 perfis ̸ 47 isolados).Os dados obtidos neste estudo ressaltam a importância de culturas de vigilância como ferramenta preventiva, destacando-se a necessidade de identificação dos mecanismos de resistência e genes envolvidos que poderão colaborar com a prevenção da crescente e relevante multirresistência bacteriana. Hospital environment, especially in the intensive care unit (ICU), the increasing incidence rate of multidrug-resistant microorganisms is considered one of the main problems of hospital infections treatment and global public health. One of the hospital routine practices in inpatients wards is the surveillance cultures monitoring of nasal, oral and rectal. The aim of this study was to evaluate the antibiotic resistance, genetic variability and clonal relations of K. pneumoniae and E. coli ESBL producers. Seventy K. pneumoniae and 47 E. coli isolates were obtained through weekly rectal surveillance cultures upon patient admission in ICU of Federal Hospital in Rio de Janeiro, between March 2013 and March 2014. The antibiotic susceptibility profiles (MIC) was assessed by automated VITEK II. The resistance genes blaSHV-1, blaTEM-1, blaOXA-1, blaKPC-2, blaOXA-48, blaCTX-M-15, blaVIM, blaIMP e blaNDM-1 were investigated by PCR and genetic diversity among the isolates was established by ERIC-PCR. E. coli and K. pneumoniae strains showed high resistance rates to cefepime (98% and 94%, respectively) and ceftazidime (100% and 96%, respectively). However, only K. pneumoniae isolates were resistant to ertapenem (61%), imipenem (54%) and meropenem (43%). For ciprofloxacin, 69% and 28% of K. pneumoniae and E. coli isolates were resistant, respectively. Genes blaSHV-1 (69%), blaTEM-1 (63%), blaCTX-M-15 (47%), blaOXA-1 (60%), blaKPC-2 (57%) and blaOXA-48 (16%) were detected in K. pneumoniae and blaTEM-1 (49%), blaCTX-M-15 (39%) and blaOXA-1 (49%) were present in isolates of E. coli. On the other hand, blaVIM, blaIMP and blaNDM-1 were not detected in any of the isolates. Additionally, we detected E. coli strains containing up to three different genes and K. pneumoniae with up to six genes responsible for the production of different β-lactamases. Molecular typing analysis showed high genetic diversity among K. pneumoniae (68 profiles 70 isolates ) and E. coli (37 profiles 47 isolates) isolates. Our data underscore the importance of surveillance cultures as a preventive tool, highlighting the need for identification of resistance mechanisms and genes involved that could collaborate with the prevention of increasing and relevant bacterial multidrug resistance.