Fundamentos: Estima-se em 8 a 10 milhões o número de indivíduos em toda América Latina com doença de Chagas, cuja forma clínica predominante é a forma indeterminada, presente em 50 a 70% dos casos. As razões que alguns pacientes desenvolvem formas clínicas diferentes ou permanecem assintomáticos não são claras. Acredita-se que marcadores imunogenéticos teciduais influenciam o tropismo de Trypanosoma cruzi em diferentes órgãos. Sistemas ABO e outros grupos sanguíneos expressam uma variedade de antígenos de carboidratos nos tecidos que influenciam a susceptibilidade ou resistência a doenças. Objetivo: Este estudo teve como objetivo analisar a associação dos sistemas ABO, Rh, Kell, Kidd, Duffy, MNS e as formas clínicas da doença de Chagas. Pacientes e métodos: Tratou-se de pesquisa descritiva e transversal, onde foram avaliadas as informações relacionadas a dados demográficos, socioeconômicos, fenotipagens eritrocitárias e comorbidades associadas à doença de Chagas de pacientes cadastrados no INI-Fiocruz entre 2013 a 2016 Resultados: Foram estudados 619 pacientes. A média de idade dos pacientes foi de 60,1±12,1 anos, com 56,9% do sexo feminino. A distribuição dos pacientes por faixa etária nas diferentes regiões do país revela que a coorte do INI está mudando seu perfil, com prevalência de indivíduos mais jovens ente 18 a 44 anos (p<0,001) oriundos dos estados do Ceará (36,5%), Paraíba (18,9%) e Rio de Janeiro (12,2%) e pacientes mais idosos oriundos de Pernambuco (16,8%), Minas Gerais (25,0%) e Bahia (30,0%). Foi encontrada diferença significativa para a distribuição da prevalência do sistema ABO entre pacientes com forma indeterminada e digestiva (p= 0,008). Não houve diferenças significantes na distribuição da prevalência dos demais sistemas sanguíneos entre as formas clínicas da doença de Chagas. Conclusão: Foi encontrada diferença significativa para a distribuição da prevalência do sistema ABO entre pacientes com forma indeterminada e digestiva. Não houve diferenças significantes na distribuição da prevalência dos demais sistemas sanguíneos entre as formas clínicas da doença de Chagas. Há mudança no perfil epidemiológico da coorte acompanhada no INI já que entre mais jovens predominam pacientes de Ceará, Paraíba e Rio de Janeiro e não mais Bahia e Minas Gerais o que reflete as ações de controle da transmissão da doença de Chagas.Background: Chagas disease affects around 8 million people throughout Latin America and 50 to 70% of the patients present the indeterminate form of the disease. The reasons that some patients develop different clinical forms or remain asymptomatic are unclear. Tissue immunogenetic markers may influence Trypanosoma cruzi tropism for different organs. ABO and other blood group systems express a variety of tissue carbohydrate antigens that influence the susceptibility or resistance to diseases. Objective: We aimed to evaluate the association of ABO, Rh, Kell, Kidd, Duffy, MNS blood group systems and the clinical forms of Chagas disease. Patients and Methods: This was a descriptive cross-sectional study which included patients with Chagas disease followed at the outpatient clinic of the INI/Fiocruz between 2013-2016. The following information were collected: demographic, socioeconomic, red blood cell phenotyping, and comorbidities Results: A total of 619 patients (60.1±12.1 years old, 56.9% female) were included in this study. Geoprocessing demonstrated that most patients younger than 45 years old were born in the states of Ceará (36.5%), Paraíba (18.9%) and Rio de Janeiro (12.2%), while most of the patients older than 65 years old were born in the states of Pernambuco (16.8%), Minas Gerais (25.0%) and Bahia (30.0%). The distribution of the ABO blood system types differed between patients with the indeterminate and digestive forms (p=0.008). The prevalence of the other blood system types did not differ among the different clinical forms of Chagas disease. Conclusion: Geoprocessing demonstrated that the epidemiological profile of the cohort followed at our service is changing from a predominance of patients from Bahia and Minas Gerais to a predominance of patients from states of Ceará, Paraíba, and Rio de Janeiro among younger patients. The distribution of the ABO blood system types differed between patients with the indeterminate and digestive forms, while the prevalence of the Rh, Kell, Kidd, Duffy and MNS blood system types did not differ among the different clinical forms of Chagas disease.