Dirofilaria immitis é o bioagente patogênico da dirofilariose, agravo frequente à saúde dos cães, principalmente em áreas costeiras de regiões tropicais e subtropicais. A dirofilariose humana é uma zoonose considerada acidental, presente em diferentes países, inclusive no Brasil. O objetivo deste estudo foi analisar a ocorrência da infecção canina por filarídeos nos municípios de Magé, Duque de Caxias, Guapimirim e Nova Iguaçu, na Baixada Fluminense, Estado do Rio de Janeiro. O estudo foi desenvolvido a partir de amostras de sangue de cães nascidos, criados e atendidos em serviços veterinários. Amostras diagnosticadas como positivas após análise pelos testes laboratoriais foram submetidas à PCR-Multiplex e sequenciamento, para identificação específica. Em todos os municípios estudados foram detectados cães infectados. A frequência geral em relação aos casos positivos de cães microfilarêmicos foi de 76,9% (113/147) e deste total, 100 amostras (88,5%) amplificaram o fragmento do gene 12S. As maiores frequências de animais parasitados das amostras do laboratório de patologia clínica foram observadas em Magé (51%; 51/100) e Duque de Caxias (40%; 40/100) (p<0,00; \03C72=23,7; OR=8,71) Cães machos foram os mais parasitados (62,3%; \03C72=1,26; p=0,25), a faixa etária entre 1 a 6 anos foi a mais acometida (62,1%; \03C72=1,96; p=0,16), e a chance de um animal de porte grande ser parasitado é 3,6 vezes maior em relação a um cão de porte médio (63,6%; \03C72=7,47; p=0,02; OR=3,64). Das amostras submetidas à reação de sequenciamento, 93,6% (73/78) foram identificadas como D. immitis e 6,4% (5/78) como Achantocheilonema reconditum. A alta frequência e a consideração de que as áreas onde vivem os cães com D. immitis são ambientes naturais para criadouros dos vetores culicídeos, permitem inferir sobre o estabelecimento e a manutenção do ciclo enzoótico na região analisada, sinalizam sua vulnerabilidade para a ocorrência do ciclo epidêmico e apontam para a possibilidade de ocorrência de casos humanos. O estudo permitiu caracterizar e determinar a ocorrência de filarioses caninas na região e possibilitou a avaliação de risco para a população humana e orientações de medidas integradas de prevenção.Dirofilaria immitis is the pathogenic bioagent of dilofilariasis, a frequent health problem to dogs, mainly in coastal areas of tropical and subtropical regions. Human dirofilariasis is a zoonosis considered to be accidental, present in different countries, including Brazil. The aim of this study was to analyze the occurrence of the canine infection caused by filarids in Magé, Duque de Caxias, Guapimirim and Nova Iguaçu municipalities, located at Baixada Fluminense, Rio de Janeiro. This study included blood samples of dogs who were born, raised and treated at veterinary services. Samples diagnosed as positive after laboratorial tests were submitted to MultiplexPCR and DNA sequencing for specific identification. Infected dogs were found in all studied municipalities. General frequency related to the positive microfilaremic dogs was 76.9% (113/147) and of these, 100 samples (88.5%) amplified the gene fragment 12S. The highest frequencies obtained from samples analyzed at the clinical pathology laboratory were from Magé (51%; 51/100) and Duque de Caxias (40%; 40/100) (p<0,00; χ2=23,7; OR=8,71). Male dogs were the most parasitized (62,3%; χ 2=1,26; p=0,25), 1 to 6 years age group was the most affected (62,1%; χ 2=1,96; p=0,16) and the chance of a large-sized dog of being parasitized is 3.6 times higher when compared to the chance of a medium-sized dog (63,6%; χ 2=7,47; p=0,02; OR=3,64). Of the samples submitted to sequencing, 93.6% (73/78) were identified as D. immitis and 6.4% (5/78) as Achantocheilonema reconditum. The high frequencies observed and the fact that the areas where the infected dogs live are natural environments for Culicidae vectors’ reproduction, allow to infer about the presence and maintenance of the enzootic cycle at the analyzed region, signalize for its’ vulnerability related to the epidemic cycle and suggest the possibility of the occurrence of human cases. This study allowed characterizing and determining the occurrence of canine filariasis at the region, evaluating the risk for the human population and guidance related to prevention.