Wolbachia pipientis é uma bactéria endossimbionte de artrópodes e nematóides filariais, presente naturalmente em cerca de 76% das espécies de insetos. Essa bactéria pode ser transmitida verticalmente (da fêmea para a prole) e horizontalmente (entre indivíduos da mesma espécie ou de espécies diferentes). Nos últimos anos, diferentes linhagens de Wolbachia tem sido utilizadas como ferramenta biotecnológica para redução da transmissão de arbovírus, através da liberação de mosquitos transfectados na natureza. A cidade do Recife é um possível alvo para aplicação da técnica devido a sua situação epidemiológica, sendo imprescindível o estudo da diversidade da população natural de Wolbachia em culicídeos presentes na cidade antes da implementação de tal programa. Assim, o objetivo deste trabalho foi de caracterizar a diversidade de linhagens de Wolbachia, bem como calcular a taxa de infecção e sua distribuição em populações naturais de mosquitos silvestres em Recife. Para tanto, foram realizadas coletas de culicídeos em duas áreas de resquício de mata atlântica do município, durante o ano de 2019. A detecção das linhagens de Wolbachia foi realizada a partir da extração de DNA, PCR para o gene wsp e regiões específicas para os supergrupos A e B; seguida de sequenciamento de um fragmento do gene wsp. Ao todo 195 amostras de mosquitos foram avaliadas quanto à presença de Wolbachia. Estas amostras foram pertencentes a 10 espécies, de cinco gêneros distintos de culicídeos. Das espécies analisadas, oito não haviam sido avaliadas até o momento quanto à presença de Wolbachia no mundo, e duas delas ainda não foram reportadas em circulação no município de Recife. Cerca de 67% das amostras analisadas foram consideradas positivas para Wolbachia, sendo encontrados os supergrupos A e B e uma taxa de infecção média de 49%. Os resultados obtidos neste trabalho são inéditos e contribuem para a ampliação do conhecimento sobre diversidade de Wolbachia em culicídeos.Wolbachia pipientis is an endosymbiont bacterium from arthropods and filarial nematodes and naturally present in about 76% of insect species. This bacterium can be transmitted both vertically (from female to offspring) and horizontally (between individuals of the same or different species). In recent years, different Wolbachia strains have been used as a biotechnological tool to reduce arbovirus transmission, through the release of transfected mosquitoes into natural populations. The city of Recife is a possible target for the application of the technique due to its epidemiological situation, being essential to study the diversity of the natural population of Wolbachia in culicids present in the city before the implementation of the program. Thus, the objective of this work was to characterize the diversity of Wolbachia strains, as to evaluate the infection rate and its distribution in natural populations of sylvatic mosquitoes in the city of Recife. For this purpose, collections of culicids were carried out in two remnants areas of Atlantic Forest in the city in 2019. The detection of Wolbachia strains was carried out through DNA extraction, PCR for the wsp gene and specific regions for supergroups A and B; followed by sequencing of the wsp gene. In total, 195 samples were analyzed for the presence of Wolbachia. This samples belongs to 10 species of five different genera of culicids. Of the species analyzed, eight had not yet been evaluated for the presence of Wolbachia in the world, and two of them had not been reported in the city of Recife. About 67% of the analyzed samples were considered positive for Wolbachia, with supergroups A and B being found and an average infection rate of 49%. The results obtained in this work are unprecedented and contribute to the expansion of knowledge about Wolbachia diversity in culicids.