Caracterização clínico-epidemiológica, espacial e laboratorial dos casos de COVID-19 no Estado de Pernambuco

The clinical-epidemiological, spatial and laboratory characterization of COVID-19 cases in the State of Pernambuco

dc.contributorPena, Lindomar José
dc.contributorCordeiro, Marli Tenório
dc.contributorReis, Christian Robson de Souza
dc.contributorAlencar, Luiz Cláudio Arraes
dc.contributorBezerra, Marcos André Cavalcanti
dc.contributorMoura, Patrícia Muniz Mendes Feire de
dc.creatorMagalhães, Jurandy Júnior Ferraz de
dc.date2022-11-09T13:00:28Z
dc.date2022-11-09T13:00:28Z
dc.date2021
dc.date.accessioned2023-09-26T20:48:56Z
dc.date.available2023-09-26T20:48:56Z
dc.identifierMAGALHÃES, Jurandy Júnior Ferraz de. Caracterização clínico-epidemiológica, espacial e laboratorial dos casos de COVID-19 no Estado de Pernambuco. 2021. 151 f. Tese (Doutorado em Biociências e Biotecnologia em Saúde) – Instituto Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2021.
dc.identifierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/55547
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8864378
dc.descriptionIntrodução: No final de dezembro de 2019, um grupo de casos de pneumonia grave de origem desconhecida foi relatado na China. A doença foi denominada como COVID-19 causada por um novo coronavírus identificado como síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2). A rápida disseminação do SARS-CoV-2 ao redor do mundo fez com que a Organização Mundial da Saúde declarasse a COVID-19 uma pandemia em 11 de março de 2020. Dados epidemiológicos e clínicos da COVID-19 tem sido documentada em vários países contribuindo na compreensão de padrões de dispersão espacial e no perfil populacional afetado. Assim, uma análise atualizada dos casos pode ajudar a aprimorar significativamente o nosso conhecimento e, consequentemente, fornecer insights sobre a COVID-19 nesta região do planeta, dado seu clima único, dinâmica social, genética populacional e cenário político. Objetivo: Caracterizar a população infectada por SARS-CoV-2 durante o ano de 2020 no estado de Pernambuco. Métodos: A tese compreendeu dois estudos. O primeiro, realizou a análise de dados epidemiológicos, clínicos, demográficos, espaciais e de diagnóstico molecular de SARS-CoV-2 dos primeiros casos ocorridos no estado de Pernambuco em 2020. O segundo abordou as características analisadas no estudo anterior ao fim do ano de 2020. Resultados: De 12 de março a 22 de abril de 2020, de um total de 2.772 casos suspeitos - 1.616 mulheres (58,30%) e 1.156 homens (41,70%) - foram coletados e testados para SARS-CoV-2 no LACEN de Pernambuco por RTqPCR. Do total de casos, 557 (20,09%) foram positivos para SARS-COV-2. Esses foram os primeiros casos de COVID-19 notificados no estado. Já ao final de 2020, Pernambuco notificou um total de 26803 casos de COVID-19, onde 13198 (49,24%) eram do sexo feminino e 13605 (50,76%) eram do sexo masculino. Realizamos análise espacial dos indivíduos que residiam em Recife no início e ao final de 2020 para fins de comparação. Nas análises iniciais, os bairros com maior poder aquisitivo possuíam as maiores incidências, fato que continuou a ocorrer ao final de 2020. Todavia, os bairros de classes com menor poder aquisitivo apresentaram as maiores incidências de óbito por COVID-19. Os sintomas mais comuns em ambas as coortes foram a tosse, seguido por febre e dispneia. Comparamos a carga viral dos casos graves com os casos leves em dias diferentes desde o início dos sintomas. Não houve diferença estatisticamente significativa na carga viral no momento do diagnóstico de pacientes com COVID-19 leve ou grave até 14 dias do início dos sintomas. No entanto, pacientes com doença grave diagnosticada após 14 dias do início dos sintomas apresentaram carga viral maior do que pacientes com doença leve. Também avaliamos a sobrevida de indivíduos que evoluíram para o óbito encontrando significância estatística na variável de cor da pele e sexo, além de verificar que indivíduos com mais de 75 anos morrem mais rapidamente em comparação com o grupo referência. Conclusão: Nosso estudo forneceu informações importantes sobre a demografia, clínica e epidemiologia da COVID-19 no mundo tropical e ajudará médicos, funcionários da saúde e gestores a enfrentar as pandemias atuais e estar mais bem preparados para combater futuras incursões de patógenos respiratórios altamente transmissíveis na população humana.
dc.descriptionIntroduction: In late December 2019, a group of severe pneumonia cases of unknown origin was reported from China. The disease was termed COVID-19 caused by a new coronavirus identified as severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARSCoV-2). The rapid spread of SARS-CoV-2 around the world prompted the World Health Organization to declare COVID-19 a pandemic on March 11, 2020. COVID-19 epidemiological and clinical data have been documented in several contributing countries in understanding spatial dispersion patterns and in the affected population profile. Thus, an up-to-date analysis of the cases can help to significantly improve our knowledge and, consequently, provide insights into COVID-19 in this region of the planet, given its unique climate, social dynamics, population genetics and political landscape. Objective: To characterize the population infected with SARS-CoV-2 during 2020 in the state of Pernambuco. Methods: The thesis comprised two studies. The first carried out the analysis of epidemiological, clinical, demographic, spatial and molecular diagnosis data of SARS-CoV-2 from the first cases that occurred in the state of Pernambuco in 2020. The second addressed the characteristics analyzed in the study prior to the end of the year of 2020. Results: From March 12 to April 22, 2020, a total of 2,772 suspected cases - 1,616 women (58.30%) and 1,156 men (41.70%) - were collected and tested for SARS-CoV- 2 at LACEN in Pernambuco by RT-qPCR. Of the total number of cases, 557 (20.09%) were positive for SARS-COV-2. These were the first cases of COVID-19 reported in the state. At the end of 2020, Pernambuco reported a total of 26803 cases of COVID-19, of which 13198 (49.24%) were female and 13605 (50.76%) were male. We performed a spatial analysis of individuals residing in Recife at the beginning and end of 2020 for comparison purposes. In the initial analyses, neighborhoods with higher purchasing power had the highest incidences, a fact that continued to occur at the end of 2020. However, neighborhoods in classes with lower purchasing power had the highest incidences of death from COVID-19. The most common symptoms in both cohorts were cough, followed by fever and dyspnea. We compared the viral load of severe cases with mild cases on different days from the onset of symptoms. There was no statistically significant difference in viral load at diagnosis in patients with mild or severe COVID-19 up to 14 days after symptom onset. However, patients with severe disease diagnosed 14 days after symptom onset had a higher viral load than patients with mild disease. We also evaluated the survival of individuals who progressed to death, finding statistical significance in the variable of skin color and gender, in addition to verifying that individuals over 75 years old die more quickly compared to the reference group. Conclusion: Our study provided important information on the demography, clinical and epidemiology of COVID-19 in the tropical world and will help physicians, health officials and managers to face current pandemics and be better prepared to combat future incursions of highly transmissible respiratory pathogens in the human population.
dc.description2022-12-29
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.rightsrestricted access
dc.subjectCOVID-19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectPandemia
dc.subjectDiagnóstico
dc.subjectEpidemiologia
dc.subjectAnálise espacial
dc.subjectSintomas clínicos
dc.subjectSobrevida
dc.subjectCOVID-19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectPandemic
dc.subjectDiagnosis
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectSpatial analysis
dc.subjectClinical symptoms
dc.subjectSurvival
dc.subjectCOVID-19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectPandemia
dc.subjectDiagnóstico
dc.subjectEpidemiología
dc.subjectAnálisis espacial
dc.subjectSíntomas clínicos
dc.subjectSupervivencia
dc.subjectCOVID-19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectPandémie
dc.subjectDiagnostic
dc.subjectÉpidémiologie
dc.subjectAnalyse spatiale
dc.subjectSigne clinique
dc.subjectSurvie
dc.subjectCOVID-19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectPerfil de Saúde
dc.subjectAnálise Espacial
dc.subjectSinais e Sintomas
dc.subjectSobrevida
dc.titleCaracterização clínico-epidemiológica, espacial e laboratorial dos casos de COVID-19 no Estado de Pernambuco
dc.titleThe clinical-epidemiological, spatial and laboratory characterization of COVID-19 cases in the State of Pernambuco
dc.typeThesis


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