Aspidodera raillieti é um nematódeo da família Aspidoderidae, parasito de marsupiais, e apresenta ciclo monoxênico. No Brasil, A. raillieti foi registrado nos estados do Amapá, Pará, Ceará, Bahia, Rio de Janeiro, Minas Gerais, São Paulo e Rio Grande do Sul parasitando diversas espécies de marsupiais da família Didelphidae. O presente trabalho teve por objetivo conhecer os padrões de estrutura populacional de A. raillieti ao longo da Mata Atlântica, baseado na diversidade genética e fenotípica. Os padrões de estrutura populacional foram determinados com base no gene mitocondrial citocromo c oxidase subunidade 1 (MT-CO1), através de inferências filogenéticas, análises de estruração populacional a partir de análise de variância molecular, índice de fixação e testes de neutralidade. A morfologia e morfometria foram analisadas por microscopia de luz e microscopia eletrônica de varredura. Cento e noventa e três espécimes de A. raillieti, parasitos de Didelphis aurita, Didelphis albiventris e Philander quica, resultaram em 118 haplótipos que se agruparam em quatro clados nas análises filogenéticas e redes de haplótipos. Clado I foi formado por espécimes parasitos de D. albiventris de Porto Alegre, RS e de Didelphis pernigra da Bolívia; clado II: espécimes parasitos de D. albiventris de Santa Rita e Mamanguape, PB, e de Porto Alegre, RS; clado III: espécimes parasitos de D. aurita do Rio de Janeiro e Paraty, RJ, de Cariacica, ES, e Curitiba, PR, parasitos de D. albiventris de Santa Rita e Mamanguape, PB e clado IV: espécimes parasitos de D. aurita do Rio de Janeiro, Paraty e Petrópolis, RJ e Curitiba, PR, por parasitos de D. albiventris de São Gonçalo do Sapucaí, MG, Curitiba, PR, e Porto Alegre, RS, e parasitos de P. quica de Santo Amaro da Imperatriz, SC Estes clados mostraram elevada diferenciação genética, o que indica ausência ou baixo fluxo gênico. Não foi observada estruturação associada às localidades, o que foi corroborado pelo teste de Mantel, que indicou baixa correlação entre distância geográfica e distância genética. Também não foi observada estruturação associada às espécies hospedeiras. Os clados III e IV ocorrem em simpatria nas localidades de Paraty e Rio de Janeiro, RJ e possuem assinatura de expansão populacional sugerindo serem decorrentes de eventos demográficos ou seleção purificadora. Análises morfológicas dos espécimes sequenciados permitiram identificadar variações intra e interpopulacionais em estruturas presentes na coifa cefálica dos nematódeos, particularmente nas projeções interlabiais e no poro presente no ápice dessas projeções, que não estão correlacionadas com os clados recuperados nas análises moleculares ou com as espécies hospedeiras. Também não foi observada diferenciação morfométrica entre espécimes de A. raillieti de diferentes espécies hospedeiras. Porém, foi observada diferenciação morfométrica entre algumas localidades, formando dois grupos principais. Estes achados permitiram concluir que há estruturação genética, de forma análoga aos agrupamentos identificados através da morfometria, que sugerem correlação com eventos pretéritos. Além disso, os clados I, III e IV são congruentes com os biomas florestais, enquanto clado II parece ser congruente com biomas de formações abertas.Aspidodera raillieti is a nematode of the family Aspidoderidae, a parasite of marsupials, with a monoxenic life cycle. In Brazil, A. raillieti was reported in the states of Amapá, Pará, Ceará, Bahia, Rio de Janeiro, Minas Gerais, São Paulo and Rio Grande do Sul, parasitizing several species of marsupials of the family Didelphidae. The present work aim to know the population structure of A. raillieti along the Atlantic Forest, based on the genetic and phenotypic diversity. The population structure patterns were determined based on the cytochrome c oxidase subunit 1 mitochondrial gene (MT-CO1), through phylogenetic inferences, analysis of population structure using molecular variance analysis, fixation index and neutrality tests. The morphology and morphometry were analyzed by light microscopy and scanning electron microscopy. One hundred and ninety-three specimens of A. raillieti, parasites of Didelphis aurita, Didelphis albiventris and Philander quica, resulted in 118 haplotypes that were grouped into four clades in phylogenetic analysis and haplotype networks. Clade I was formed by parasitic specimens of D. albiventris from Porto Alegre, RS and Didelphis pernigra from Bolivia; Clade II: specimens from D. albiventris from Santa Rita and Mamanguape, PB, and Porto Alegre, RS; Clade III: parasitic specimens of D. aurita from Rio de Janeiro and Paraty, RJ, from Cariacica, ES, and Curitiba, PR, parasites of D. albiventris from Santa Rita and Mamanguape, PB and Clade IV: parasitic specimens of D. aurita from Rio de Janeiro, Paraty and Petrópolis, RJ and Curitiba, PR, for parasites of D. albiventris from São Gonçalo do Sapucaí, MG, Curitiba, PR, and Porto Alegre, RS, and parasites of P. quica from Santo Amaro da Imperatriz , SC These clades showed high genetic differentiation, which indicates absence or low gene flow. There was no structuring associated with the locations, which was corroborated by the Mantel test, which indicated a low correlation between geographic and genetic distances. Clades III and IV occur in sympatry in the locations of Paraty and Rio de Janeiro, RJ and have a population expansion signature suggesting demographic events or purifying selection. Morphological analysis of the sequenced specimens allowed the identification of intra and interpopulation variations in structures present in the nematode cephalic cap, particularly in the interlabial projections and in the pore present at the apex of these projections, which are not correlated with the Clades recovered in the molecular analysis or with the host species. There was also no morphometric differentiation between specimens of A. raillieti from different host species. However, morphometric differentiation was observed between some locations, forming two main groups. These findings allowed us to conclude that there is a genetic structure, similar to the clusters identified through morphometry, which suggest correlation with past events. In addition, clades I, III and IV are congruent with forest biomes, while clade II appears to be congruent with biomes of open formations.2022-06-30