Este artigo faz uma revisão das principais teorias e autores que desenvolveram estudos críticos sobre as teorias organizacionais. A organização publica de saúde foi o universo de estudo, no seu duplo aspecto: estrutura e dinâmica. Foi apresentado o pensamento inovador de alguns autores dessa área, referido as categorias descentralização e autonomia. Considerou-se que deveria existir uma relação de interdependência entre a implementação de uma política publica e a estruturação de uma organização. Conclui-se que, para um Estado que se visse cercado por um conjunto de situações novas quer no plano político quanto institucional, tanto a descentralização quanto a autonomia apareceriam como alternativas viáveis.This article reviews the main theories and authors that developed critical studies on organization theory. Public health organizations are the universe of this study in both aspects: structure and dynamics. Innovative perspectives are presented with reference to decentralization and autonomy in this area. An interdependent relationship among the implementation of a public policy an organization's structure and these categories is supposed to exist. The conclusion is that decentralization and autonomy would be one of the possible alternatives for a State that were experiencing new situations at both political and institutional level.