Os nematoides parasitos são um grupo altamente prevalente e diverso em organismos aquáticos, porém sua biodiversidade é subestimada. Uma vez que esses parasitos também devem ser considerados como componentes da biodiversidade global e desempenham um papel importante nos ecossistemas, estudos taxonômicos em uma microescala neste grupo constituem passo fundamental para compreensão de fenômenos e relações ecológicas em uma macroescala. No Brasil, é baixa a resolução taxonômica da maioria dos estudos de nematoides parasitos de organismos aquáticos, e poucos realizam a caracterização genética dos mesmos. Sendo assim, o objetivo do presente trabalho foi identificar, através da integração da taxonomia clássica e molecular, as espécies de nematoides parasitas de peixes teleósteos e mamíferos marinhos do litoral brasileiro. Espécimes de anisaquídeos (n=245) foram coletados de 63 cetáceos de 12 espécies diferentes encalhados no litoral nordeste do país. Sessenta espécimes de três espécies de peixe, Genypterus brasiliensis, Micropogonias furnieri e Mullus argentinae, foram coletados sazonalmente entre 2012-2014 no litoral do Rio de Janeiro. Foram identificadas cinco espécies de anisaquídeos em cetáceos da costa do Nordeste do Brasil - Anisakis typica, A. ziphidarum, A. nascettii, A. brevispiculata e A. paggiae, e seis espécies de nematóides em peixes teleósteos do litoral Sudeste- Dichelyne (Cucullanelus) sciaenidicola, Cucullanus pulcherrimus, Hysterothylacium deardorffoverstreetorum, A. typica, C. genypteri e Procamallanus (S.) halitrophus A espécie H. deardorffoverstreetorum foi validada através de caracterização morfológica e molecular de um espécimen macho adulto, e a nomenclatura H. deardorffoverstreetorum senso lato é proposta. As espécies D. (C.) sciaenidicola, C. genypteri, C. pulcherrimus e Procamallanus (S.) halitrophus foram caracterizadas geneticamente pela primeira vez. Novos dados de distribuição geográfica -A. ziphidarum, A. nascettii, A. brevispiculata e A. paggiae em águas do Atlântico Sul são apresentados. Os hospedeiros - Stenella longirostris para Pseudoterranova sp., M. furnieri para A. typica, M. argentinae para P. (S.) halitrophus e as três espécies de peixes estudadas para H. deardorffoverstreetorum (s.l), são revelados pela primeira vez. Perfis especialistas foram confirmados nas espécies A. nascettii, A. paggiae, A. brevispiculata, D.(C.) sciaenidicola e C.genypteri. Com relação à ecologia dos parasitos de peixe, não foi observada uma variação sazonal significativa nos índices parasitários. O presente trabalho demonstrou a importância do estudo integrativo para a identificação taxonomica, contribuindo com informação básica sobre a distribuição, ecologia e a relação parasito-hospedeiro, além de enriquecer o conhecimento acerca da biodiversidade de parasitos em ecossistemas marinhos do Brasil.Parasitic nematodes are a highly prevalent and diverse group on aquatic organisms, both of freshwater and marine ecosystems. Since parasitic nematodes of aquatic organisms should be considered as a component of global biodiversity and play an important role in ecosystems, taxonomic studies on a micro-scale in this group are an essential step to understanding phenomena and ecological relationships on a macro-scale. In Brazil, taxonomic resolution is low, regarding most of studies on nematodes parasites of aquatic organisms. Based on this, the aim of the present study is identify, through integration of classical and molecular taxonomy, nematode species parasites of teleost fish and marine mammals from Brazilian littoral. Anisakid specimens (n=245) were collected from 63 cetaceans belonging to 12 different species stranded along the northeast coast of the Country. Sixty specimens of three fish species, Genypterus brasiliensis, Micropogonias furnieri and Mullus argentinae were collected seasonally between 2012-1014 on Rio de Janeiro littoral. Five anisakid species were identified in cetaceans from the Northeast coast- Anisakis typica, A. ziphidarum, A. nascettii, A. brevispiculata and A. paggiae, and six species parasitizing teleost fish from the Southeastern Coast- Dichelyne (Cucullanelus) sciaenidicola, Cucullanus pulcherrimus, Hysterothylacium deardorffoverstreetorum, A. typica, C. genypteri and Procamallanus (S.) halitrophus The species H. deardorffoverstreetorum was va lidated by morphological and molecular characterization of an adult male specimen, and the nomenclature H. deardorffoverstreetorum senso lato is proposed. The species D. (C.) sciaenidicola, C. genypteri, C. pulcherrimus and Procamallanus (S.) halitrophus comb. n were genetically characterized for the first time. New geographical distribution records- A. ziphidarum, A. nascettii, A. brevispiculata and A. paggiae in South Atlantic waters are presented. The hosts- Stenella longirostris for Pseudoterranova sp., M. furnieri for A. typica, M. argentinae for P. (S.) halitrophus and the three fish species studied for H. deardorffoverstreetorum (s.l), are revealed for the first time. Specialist profiles were confirmed in the species A. nascettii, A. paggiae, A. brevispiculata, D.(C.) sciaenidicola and C. genypteri. Regarding parasites' ecology, significant seasonal variability was not observed on parasitary indexes. The current study demonstrated the importance of integrative studies to taxonomic identification, contributing with basic information about distribution, ecology and host-parasite relationship, besides enriching the knowledge of parasite biodiversity in marine ecosystems in Brazil.2500-12-31