A avaliação da presença de parasitoses em populações antigas, seja por meio de abordagens paleoparasitológicas ou paleogenéticas, permite o estudo da origem e dispersão de parasitos, assim como a determinação da epidemiologia molecular no passado. No trabalho apresentado foram estudadas questões específicas a tuberculose, sífilis e parasitoses intestinais no período Colonial Brasileiro. A tese está no formato \201Ccoletânea\201D e são apresentados 2 artigos publicados e 1 submetido a publicação. No primeiro artigo, foi abordada a presença da infecção pelo Complexo Mycobcaterium tuberculosis (MTC) em nativos da população Tenetehara-Guajajara, no Estado do Maranhão, que apresentavam lesões paleopatológicas sugestivas de tuberculose. A genotipagem das cepas de MTC identificadas, apontou para a influência de Africanos ou Europeus na disseminação da infecção no Brasil. Este é o primeiro registro da infecção em ameríndios nativos do período pós-contato. No segundo artigo foi reportado o sucesso na detecção de aDNA de T. pallidum em remanescentes humanos provenientes de 2 sítios arqueológicos do período histórico Brasileiro, Igreja Nossa Senhora do Carmo e cemitério Praça XV. O resultado foi atribuído aos critérios adotados baseados na fisiopatologia da T. pallidum, e nos dados epidemiológicos da população do estudo. aDNA de T. pallidum foi detectado em 2 indivíduos, e em um deles, o diagnóstico de sífilis foi sugerido. No terceiro artigo, a aplicação de análises paleoparasitológicas e paleogenéticas em remanescentes humanos do sítio arqueológico cemitério dos Pretos Novos (CPN), Rio de Janeiro, permitiu estudar a infecção por helmintos intestinais. Mesmo trabalhando com ossos submetidos à queima como procedimento do CPN e terem passado por processo de curadoria no Instituto de Arqueologia Brasileira, foi possível a detecção de T. trichiura e Ascaris sp. Considerando que o propósito do CPN era depositar corpos de Africanos escravizados que morriam assim que chegavam ao Brasil, se sugere que estas infecções foram trazidas da África para o Brasil durante o período Colonial.The evaluation of the presence of parasites in ancient populations, either through paleoparasitological or paleogenetic approaches, allows the study of the origin and dispersion of parasites, as well as, the determination of molecular epidemiology in the past. In the present study, specific issues for tuberculosis, syphilis and intestinal parasites in the Brazilian Colonial period were studied. The thesis is in the format "collection" and are presented 2 published papers and 1 paper submitted to publication. In the first paper, the presence of the infection by the Mycobcaterium tuberculosis Complex (MTC) in natives of the Tenetehara-Guajajara population, from State of Maranhão, who had paleopathological lesions suggestive of tuberculosis. The genotyping of the MTC strains pointed to the influence of Africans or Europeans on the dissemination of infection in Brazil. This is the first record of infection in Native Amerindians of the post-contact period. In the second paper, the success in the detection of aDNA of T. pallidum in human remains from 2 archaeological sites of Brazilian historical period, Nossa Senhora do Carmo Church and Praça XV Cemetery, was reported. The result was attributed to the criteria adopted based on the pathophysiology of T. pallidum and epidemiological data of the population studied. aDNA of T. pallidum was detected in 2 individuals, and in one of them, the diagnosis of syphilis was suggested. In the third paper, the application of paleoparasitological and paleogenetic analyses in human remains of the archaeological site of the Pretos Novos cemetery (CPN), Rio de Janeiro, allowed the study of intestinal helminths infection. Even working with bones, that were subjected to burning as a CPN procedure and having undergone a curatorship process at the Brazilian Archaeology Institute, it was possible to detect T. trichiura and Ascaris sp. Considering that the purpose of the CPN was to deposit bodies of African slaves who died as soon as they arrived in Brazil, it is suggested that these infections were brought from Africa to Brazil during the Colonial period.