Resumen Introducción: Aun son escasos los estudios que recomiendan los pacientes con fibrilación auricular en los programas de rehabilitación cardiaca. Objetivo: Evaluar los efectos del entrenamiento físico en pacientes con fibrilación auricular en régimen de rehabilitación cardiovascular. Metodología: Se realizó un estudio pre-experimental, prospectivo, tipo pretest- postest con 18 pacientes con fibrilación auricular que asistieron durante 12 semanas a las sesiones de rehabilitación cardiaca. Se evaluó el paciente al inicio y finaldel programa con ergometría con gases espirados, análisis de sangre y ecocardiograma transtorácico. Resultados: Predominaron el sexo masculino (72.2 %), el diagnóstico de miocardiopatías (33.3 %), la hipertensión arterial (100 %) y la fibrilación auricular persistente de larga duración (55.6 %). Se encontró una diferencia estadísticamente significativa para cada variable morfofuncional: índice de masa corporal (28.0±5.0 vs. 26.9±4.4, p< 0.0001), consumo de oxígeno pico (13.6±3.0 vs. 15.3±2.9, p<0.0001), consumo de oxígeno en el umbral anaerobio (9.9±2.2 vs. 10.7±2.0; p=0.007), equivalente ventilatorio para dióxido de carbono (27.7±4.7 vs. 26.6±4.7; p<0.0001), equivalente ventilatorio para el oxígeno (24.2±5.0 vs. 23.8±4.9 p=0.001), pulso de oxígeno (10.2±2.5 vs. 12.1±2.1; p< 0,0001), unidades metabólicas (3.8±0.9 vs. 4.3±0.9; p<0.0001) y fracción de eyección ventricular izquierda (55,7±8,7 vs. 58,2±7,5, p=0,003). Las variables metabólicas disminuyeron significativamente (p<0.0001). La clase funcional de Weber mejoró en 5 pacientes (27.8 %). Conclusiones: El entrenamiento físico de pacientes con fibrilación auricular durante 12 semanas de rehabilitación cardiovascular mejoró la capacidad funcional, con incrementos evolutivos de la fracción de eyección ventricular izquierda y disminución de las variables metabólicas, sin generar riesgos ni complicaciones.