Fil: Niembro, Andrés A. Universidad Nacional de Río Negro. Centro Interdisciplinario de Estudios sobre Territorio, Economía y Sociedad. Río Negro; Argentina.Regional inequalities and the role of innovation as a determinant of development have been at the heart of the literature on regional innovation systems (RIS). Howe-ver, empirical contributions have not commonly addressed these phenomena over time. The objective of this article is to analyze the inequalities between RIS in Argentina during the period 2003-2013 through the development of a synthetic index and different subdimensions. The results show the continuity of deep heteroge-neities between RIS, which leads us to rethink public policies in this period and highlights the need for future interventions addressing territorial inequalities.trueLas desigualdades regionales y la innovación, como determinante del desarro-llo, han estado presentes en la literatura sobre sistemas regionales de innovación (SRI), pero los aportes empíricos generalmente no han abordado estos fenó-menos. El objetivo de este artículo es analizar las desigualdades entre los SRI en Argentina durante el periodo 2003-2013 mediante la elaboración de un índice sintético y diferentes subíndices. Los resultados muestran la persistencia de profundas heterogeneidades entre los SRI, lo que lleva a repensar las polí-ticas públicas en dicho periodo y, a futuro, demandar intervenciones que atiendan las desigualdades territoriales.