Bioinformatic Studies for the Identification of Possible Therapeutic Targets in Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Disease: Estudios bioinformáticos para la identificación de posibles dianas terapéuticas en la enfermedad de Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA)

dc.creatorLópez Pérez, Iván
dc.creatorValencia Silva, Alex
dc.creatorVarela Polit, Luis
dc.creatorGalarza, Cristian Fernando
dc.date2023-06-26
dc.date.accessioned2023-08-29T21:46:51Z
dc.date.available2023-08-29T21:46:51Z
dc.identifierhttps://revistas.uta.edu.ec/erevista/index.php/aci/article/view/2034
dc.identifier10.31243/aci.v30i1.2034
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8520835
dc.descriptionAmyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a neurodegenerative disease characterized by the progressive loss of neurons in different areas of the central nervous system, which in a short time causes the death of the patient. Biological databases such as MalaCards, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), Harmonizome and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) were used, the most relevant genes were grouped according to the dysfunction they cause in the genes and according to the score value assigned in each of them. Twenty-six elite genes were selected from which interaction networks were designed to identify the most important connections between the proteins synthesized by these genes. From these pathways, genes following SOD1 gene mutations were chosen to select the domains that meet the best drugability criteria and through a virtual screening the domains that offer the best conditions for ligand binding that could later be transformed into potential drugs were selected; these receptors were validated using the DrugBank database. The Valosin Containing Protein (VCP) and VAMP Associated Protein B and C (VAPB) genes were identified as the most important genes related to the disease, and the protein receptors Transitional endoplasmatic reticulum and Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C together with their targets, Saquinavir and Astemizole, two commercial drugs whose toxicological properties were analyzed to ensure their applicability. Saquinavir presented better properties in the evaluation of Quantitative Structure-Activity Ratio (QSAR) and Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion and Toxicity (ADMET) properties, on the other hand, Astemizole exhibited greater stability since it presents hydrogen bonding, which is responsible for providing this characteristic to the binding.en-US
dc.descriptionLa Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA) es una enfermedad neurodegenerativa caracterizada por la pérdida progresiva de neuronas en diferentes áreas del sistema nervioso central lo que en poco tiempo causa la muerte del paciente. Se utilizó bases de datos biológicas tales como MalaCards, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), Harmonizome y Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), los genes más relevantes fueron agrupados de acuerdo con la disfunción que causan en los genes y de acuerdo con el valor de puntuación asignada en cada una de ellas. Se seleccionó 26 genes élite a partir de los cuales se diseñaron redes de interacción para identificar las conexiones más importantes entre las proteínas que sintetizan estos genes. De estas rutas se escogieron los genes que siguen las mutaciones del gen SOD1 para seleccionar los dominios que cumplen con los mejores criterios de drugabilidad y a través de un cribado virtual se seleccionó los dominios que ofrecen las mejores condiciones para la unión de ligandos que posteriormente se podrían transformar en posibles medicamentos, estos receptores se validaron utilizando la base de datos DrugBank. Se identificaron los genes Valosin Containing Protein (VCP) y VAMP Associated Protein B and C (VAPB) como los genes más importantes relacionados con la enfermedad, y los receptores proteicos Transitional endoplasmatic reticulum y Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C junto a sus dianas, Saquinavir y Astemizole, dos fármacos comerciales de los cuales se analizó las propiedades toxicológicas para garantizar su aplicabilidad. El Saquinavir presentó mejores propiedades en la evaluación de la Relación Cuantitativa Estructura-Actividad (QSAR) y las propiedades de Absorción, Distribución, Metabolismo, Excreción y Toxicidad (ADMET), por otra parte, Astemizole exhibió mayor estabilidad ya que presenta enlaces de puentes de hidrógeno, que son los responsables de proporcionar esta característica a la unión.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherUniversidad Técnica de Ambato - FCIALes-ES
dc.relationhttps://revistas.uta.edu.ec/erevista/index.php/aci/article/view/2034/2426
dc.rightsDerechos de autor 2023 Iván López Pérez; Alex Valencia Silva; Luis Varela Polit, Cristian Fernando Galarzaes-ES
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0es-ES
dc.sourceAlimentos Ciencia e Ingeniería; Vol. 30 No. 1 (2023): Alimentos Ciencia e Ingeniería; 1-26en-US
dc.sourceAlimentos Ciencia e Ingeniería; Vol. 30 Núm. 1 (2023): Alimentos Ciencia e Ingeniería; 1-26es-ES
dc.source2737-6338
dc.source1390-2180
dc.source10.31243/aci.v30i1
dc.subjectALS, Therapeutic Target, Computer Aided Drug Design.es-ES
dc.titleBioinformatic Studies for the Identification of Possible Therapeutic Targets in Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Disease: Estudios bioinformáticos para la identificación de posibles dianas terapéuticas en la enfermedad de Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA)es-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typePeer-reviewed Articleen-US
dc.typeArticulo evaluado por pareses-ES
dc.coverageBiioinformáticaes-ES


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