The present investigation was carried out in the Yaguachi canton, Guayas province with the objective of evaluating the response of six F6 rice lines in segregating populations derived from interspecific crosses between Oryza sativa L. ssp. japonica x Oryza rufipogon G. and crosses of japonica-type lines. For the statistical analysis, the different variables were subjected to an Analysis of Variance (ANOVA) and the Tukey 5% test, to determine statistical significance and to differentiate or compare the values of the variables studied. The study factor in this research was the severity of the frequent pathogens on the stem and grain, mainly caused by: Rhizoctonia oryzae, Gaeumannnomyces graminis, Sarocladium oryzae and Grain Spotted Complex. According to the analysis of variance, there was high statistical significance (<0.0001), in all the variables evaluated. Tukey's analysis (5%), identified 5 lines tolerant to Rhizoctonia oryzae; 1 line for Gaeumannnomyces graminis; 4 lines for Sarocladium oryzae and 1 line for the Grain Stain Complex.La presente investigación se realizó en el cantón Yaguachi, provincia del Guayas con el objetivo de evaluar la respuesta de seis líneas F6 de arroz en poblaciones segregantes derivadas de cruces interespecíficos entre Oryza sativa L. ssp. japonica x Oryza rufipogon G. y de cruces de líneas de tipo japónicas. Para el análisis estadístico las diferentes variables fueron sometidas a un Análisis de Varianza (ANOVA) y al test de Tukey 5%, para la determinación de la significancia estadística y para diferenciar o comparar los valores de las variables estudiadas. El factor de estudio en esta investigación fue la severidad de los patógenos frecuentes en el tallo y grano causada principalmente por: Rhizoctonia oryzae, Gaeumannnomyces graminis, Sarocladium oryzae y Complejo Manchado de Grano. Según el análisis de varianza existió alta significancia estadística (<0,0001), en todas las variables evaluadas El análisis de Tukey (5%), identificó 5 líneas tolerantes a Rhizoctonia oryzae; 1 línea para Gaeumannnomyces graminis; 4 líneas para Sarocladium oryzae y 1 línea para el Complejo del manchado de grano.