Canine Monocytic Ehrlichiosis (CME) is caused by Ehrlichia canis, a disease transmitted by ticks of the species Riphicephalus sanguinius. Its clinical presentation can vary from acute to chronic phases. In Latin America, there are several studies on ehrlichiosis, where it is considered an emerging zoonotic infection in humans. The objective of this research is to apply conventional PCR (cPCR) testing on seropositive canine samples from the BioNote CaniV-4 rapid test in the city of Naranjal (Guayas-Ecuador) to detect genetic material of Ehrlichia canis and determine the frequency of positive animals for canine ehrlichiosis. This study is based on an observational, cross-sectional design, using a quantitative approach. The cPCR technique was implemented as the diagnostic method to detect genetic material of Ehrlichia canis in seropositive canine samples using the CaniV-4 rapid test. A total of 34 canine samples were analyzed using cPCR, and genetic material of Ehrlichia canis was detected in 18 samples (52.94%), while no genetic material was detected in 16 samples (47.05%). Therefore, the interpretation of rapid diagnostic test results should be done with caution, as they are limited to detecting antibodies and not the presence of the pathogen. Using a rapid test based on immunochromatography does not provide a reliable result for diagnosis, especially as a post-treatment control for Ehrlichiosis.La Ehrlichiosis monocítica canina (EMC) es causada por Ehrlichia canis, enfermedad transmitida por  garrapatas de la especie Riphicephalus sanguinius, su presentación clínica puede variar desde la fase aguda hasta una fase crónica, en América Latina existen varios estudios sobre ehrlichiosis en donde se considera una infección zoonótica emergente en humanos. El objetivo de esta investigación es aplicar la prueba de PCR convencional (cPCR) en  muestras de caninos seropositivos al test rápido CaniV-4 de BioNote en la ciudad de Naranjal (Guayas-Ecuador) con el fin de detectar material genético de Ehrlichia canis y determinar la frecuencia de animales positivos a  Ehrlichiosis canina. La siguiente investigación se basa en un diseño observacional, descriptivo de tipo transversal, bajo un enfoque cuantitativo. En donde se implementó como técnica diagnóstica el uso de cPCR  para la detección de material genético de Ehrlichia canis  en muestras de caninos seropositivos mediante el test rápido CaniV-4. Se analizó 34 muestras de caninos mediante cPCR y se detectó material genético de Ehrlichia canis en 18 muestras (52,94%) y en 16 muestras (47,05%) no se detectó material genético en cPCR. Por lo tanto la interpretación de los resultados de las pruebas diagnósticas rápidas debe realizarse con precaución ya que  estas se limitan a detectar anticuerpos y no la presencia del patógeno; usar un test rápido basado en inmunocromatografía no da un resultado confiable para el diagnóstico y menos aún como control después del tratamiento de la Ehrlichiosis.